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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003531`

染色体: Chr05 坐标: 47176137-47182934 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003531`
名称	SmilChr05G003531
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 5
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47176137 - 47182934 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024604`
GeneID	`131024604`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024604`
原始查询	`SmilChr05G003531`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 5
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 5
Arabidopsis	`AT1G31970` (STRS1) DEA(D/H)-box RNA helicase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840087] identity=79.4; qcov=0.818; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0301200` (OsRH5) - identity=73.6; qcov=0.893; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006364 (rRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024604

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810097.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057810097.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810097.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810097.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810097.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47179699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B100,B24,B80,C41
`Chr5:47180536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:47182333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:47182383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:47182384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:47182429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B112,B122,B94
`Chr5:47182667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr5:47182728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810097.1

534 aa

267

534

DEAD

ResIII

Helicase_C

PF00270 DEAD 138-309 aa PF04851 ResIII 157-303 aa PF00271 Helicase_C 352-459 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810097.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	138	309	2.2e-48	164.9	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057810097.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	157	303	1.8e-05	25.4	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057810097.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	352	459	6.3e-34	117.3	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954114.1
GTCTGTTGAATTAAACGAAAAATAGAAAAAATGGAGCCTTAAAAAGCTCTTGGCAGCTCTCCACCCAATTTGCCGCCACACCCAAAACCTACAACCCGTAACTGCTCCTTTCCTCTCTAGGGTTTTGGGGGTCATATTCATCAATCATCAAAGTCATGGCTGGCCCAAAGAAGCAGCAAACTGAAGCAGGCATCATGCAAAATAGCGAAACCAAGCTCCACAAGAAGCACAAGAACAAGCAGAAGAGAAAAATTGAGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024604
ATGGCTGGCCCAAAGAAGCAGCAAACTGAAGCAGGCATCATGCAAAATAGCGAAACCAAGCTCCACAAGAAGCACAAGAACAAGCAGAAGAGAAAAATTGAGGAGATTGATGCGGAAGATGTGGAAATTGAGCAAAAGTTAGAAGAGGAGATTTTGGATGCTGGGTCCACGGAAATCTCGAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGACAAGGAGGGAGATGGTGTGAGTGAGAAGGAGGCAAGTGAGAGGAAAGTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810097.1
MAGPKKQQTEAGIMQNSETKLHKKHKNKQKRKIEEIDAEDVEIEQKLEEEILDAGSTEISKKKKKKKKKDKEGDGVSEKEASERKVAETAEEEVIESIGVVVSGKNVNESKYKALNSFVESGLPEEVLECCKAFDKPSPIQSHSWPFLLDGRDLIGIAATGSGKTLAFGIPAIRHVLNKRKSNTSKKVNPRCLVLSPTRELAQQISDVLCDAGKPSGVKSVCIYGGTSKGPQISSLKAGVDIVIGTPGRLKDLIEMGVCR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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