当前解析结果
SmilChr05G003532| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003532 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003532 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003532 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 47185872 - 47186684 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024605 |
|---|---|
| GeneID | 131024605 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024605 |
| 原始查询 | SmilChr05G003532 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024605 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057810098.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810098.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810098.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057810098.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057810098.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:47185894 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C28 |
Chr5:47185919 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B131,B46,B53 |
Chr5:47185919 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,B46,B53 |
Chr5:47185922 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,B102,C82 |
Chr5:47185928 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B112,C28 |
Chr5:47185931 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B112,C28 |
Chr5:47185936 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 67 | A1,A11,A14,A2,A21,A23,A24,A4,A5,B1,B100,B105,B108,B11,B113,B119,B122,B132,B133,B136,B139,B15,B21,B25,B27,B30,B31,B34,B4,B40,B45,B47,B51,B52,B55,B56,B58,B64,B68,B7,B73,B8,B80,B81,B82,B93,B94,B96,C12,C29,C31,C32,C33,C36,C41,C42,C47,C48,C5,C52,C58,C64,C65,C66,C68,C80,D1 |
Chr5:47185943 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A22 |
Chr5:47185952 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A25 |
Chr5:47185952 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A25 |
Chr5:47185953 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B102,B131,B46,B53 |
Chr5:47185975 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C45 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。