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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003534`

染色体: Chr05 坐标: 47206169-47207380 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003534`
名称	SmilChr05G003534
描述	uncharacterized SmilChr05G003534
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47206169 - 47207380 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026027`
GeneID	`131026027`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026027`
原始查询	`SmilChr05G003534`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=55.2; qcov=0.386; evalue=2.03e-34; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=48; qcov=1.04; evalue=1.12e-121; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026027

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811788.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057811788.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811788.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811788.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811788.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47206208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C51
`Chr5:47206208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr5:47206218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr5:47206219`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A22
`Chr5:47206219`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A22
`Chr5:47206239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C9
`Chr5:47206268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr5:47206415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr5:47206589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr5:47206607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr5:47206631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B56,C32,C68,C8
`Chr5:47206639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811788.1

370 aa

185

370

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 30-69 aa PF04827 Plant_tran 137-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811788.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	30	69	2.7e-19	69.3	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057811788.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	137	304	1.2e-72	244.5	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955805.1
ATGCAAGTAGCAAGTTCATATCGGTTCGATCCACCTCCACAACGCCCGGCGAAAAAGCGGGCAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTCGCCGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCGGATGCTGTTGGCCGGGTGGGCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026027
ATGCAAGTAGCAAGTTCATATCGGTTCGATCCACCTCCACAACGCCCGGCGAAAAAGCGGGCAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTCGCCGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCGGATGCTGTTGGCCGGGTGGGCTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811788.1
MQVASSYRFDPPPQRPAKKRAVVRRDREGGAERLHRDYFAVEPVYGPQFFRRRFRMSRELFLRIVNALEVDPYFQQRPDAVGRVGFSPIQKCTAAIRQLAYGNSADCCDEYLRIGETTALECLKKFCKAVVRIFGGTYLRRPTTADVQRITAMHEARHGFPGMLGSLDYMHWGWKNCPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNDVLAGHAAAVHFLANNSHHTRGYYLTDGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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