当前解析结果
SmilChr05G003537| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003537 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003537 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003537 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 47230460 - 47230873 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131026028 |
|---|---|
| GeneID | 131026028 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026028 |
| 原始查询 | SmilChr05G003537 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0484800- identity=27.6; qcov=0.766; evalue=2.45e-07; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026028 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057811789.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057811789.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811789.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811789.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811789.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:47230480 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,B21 |
Chr5:47230486 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B112,B122,B94 |
Chr5:47230492 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr5:47230516 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr5:47230517 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B101,B119,B134,C3,C8 |
Chr5:47230560 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr5:47230612 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B110,B124,B16,C22,C67 |
Chr5:47230616 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr5:47230620 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B112,C28 |
Chr5:47230644 |
ACT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B110,B124,B16,C22,C67 |
Chr5:47230644 |
ACT |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | B110,B124,B16,C22,C67 |
Chr5:47230648 |
T |
TGC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 5 | B110,B124,B16,C22,C67 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。