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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003547`

染色体: Chr05 坐标: 47393127-47394923 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003547`
名称	SmilChr05G003547
描述	uncharacterized SmilChr05G003547
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47393127 - 47394923 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026032`
GeneID	`131026032`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026032`
原始查询	`SmilChr05G003547`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=50.9; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0301400` - identity=39.6; qcov=0.681; evalue=1.41e-96; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026032

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811792.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811792.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811792.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811792.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811792.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47393281`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	35	A16,A3,B10,B102,B105,B106,B110,B127,B15,B24,B27,B4,B42,B43,B59,B73,B76,B94,C12,C13,C20,C21,C28,C29,C31,C33,C35,C41,C48,C57,C73,C79,D1,D6,D9
`Chr5:47393293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B53,C9
`Chr5:47393406`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B10,B108,B128,B2,B64,B91,C41,C7
`Chr5:47393463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B7,B96,D7
`Chr5:47393481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B139,B43
`Chr5:47393535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B84,B91
`Chr5:47393539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B26,B66
`Chr5:47393560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr5:47393631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B40
`Chr5:47393631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr5:47393745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C33
`Chr5:47393758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811792.1

598 aa

299

598

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

PF14291 DUF4371 2-174 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 59-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811792.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	2	174	7.5e-80	268.6	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057811792.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	59	179	5.9e-13	49.5	FAM200/ZBED5 RNase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955809.1
ATGAGGTTAAATGCATCAATTGACTGTATTCGATTTCTTTTACGTCAGGGACTTGCATTCCGTGGTGATGATGAATCAAAGACTTCAGCCAATCGGGGTAACTTTCTTGAGCTTTTGAATTTTATGGCAGATCACAATGATGATATTAAATGTGTTATAAATGGTGCTCCTGAAAATCTCAAATTGATAGCACCTAGTATTCAAAAGGATATTGTGAATGTTGCTGCAGTGAAAACTATTAATATCATCATGGAAGAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026032
ATGAGGTTAAATGCATCAATTGACTGTATTCGATTTCTTTTACGTCAGGGACTTGCATTCCGTGGTGATGATGAATCAAAGACTTCAGCCAATCGGGGTAACTTTCTTGAGCTTTTGAATTTTATGGCAGATCACAATGATGATATTAAATGTGTTATAAATGGTGCTCCTGAAAATCTCAAATTGATAGCACCTAGTATTCAAAAGGATATTGTGAATGTTGCTGCAGTGAAAACTATTAATATCATCATGGAAGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811792.1
MRLNASIDCIRFLLRQGLAFRGDDESKTSANRGNFLELLNFMADHNDDIKCVINGAPENLKLIAPSIQKDIVNVAAVKTINIIMEEMRGSLFSILVDESRDISMKEQMAIVLRFVNKDGCIVERFVGVEHVTSTTALALKEAICCFFSRHNLSISRLRGQGYDGASNMQGAFNGLKALILKENPCAFYIHCFAHQLQLALVVVAKKHILVSALFFSGTSVVNVVGASSKRCDILHQKETEKIFSALNNGDLVSGRGLNQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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