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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr05G003557

染色体: Chr05 坐标: 47503541-47505664 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr05G003557
名称SmilChr05G003557
描述UDP-glucose flavonoid 3-O-glucosyltransferase 7-like
染色体 / SeqIDChr05 / NC_080391.1
坐标与链方向47503541 - 47505664 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130987053
GeneID130987053
locus_tag-
NCBI NameLOC130987053
原始查询SmilChr05G003557

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述UDP-glucose flavonoid 3-O-glucosyltransferase 7-like
产物UDP-glucose flavonoid 3-O-glucosyltransferase 7-like
ArabidopsisAT1G51210 (AT1G51210)
UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841544]
identity=29.9; qcov=0.947; evalue=2.86e-49; confidence=low
RiceOs01g0176100
-
identity=28.8; qcov=1.05; evalue=1.01e-48; confidence=low
GOGO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity)
KEGG-
PfamPF00201 (UDPGT)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130987053

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytosol 细胞质基质 1.00000 XP_057766594.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.80000 XP_057766594.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057766594.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057766594.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057766594.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr5:47503885 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D7
Chr5:47503966 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A23
Chr5:47504020 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 A8,B138
Chr5:47504347 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C71
Chr5:47504352 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D10
Chr5:47504367 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A10
Chr5:47504505 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A7,B65,C56,C76,D6
Chr5:47504507 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B135
Chr5:47504511 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B135
Chr5:47504668 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B13,D10,D6
Chr5:47504734 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766594.1
542 aa
N
1
271
542
UDPGT
C
PF00201 UDPGT 329-508 aa
XP_057766595.1
538 aa
N
1
269
538
UDPGT
C
PF00201 UDPGT 325-504 aa
XP_057766596.1
530 aa
N
1
265
530
UDPGT
C
PF00201 UDPGT 317-496 aa
XP_057766597.1
518 aa
N
1
259
518
UDPGT
C
PF00201 UDPGT 305-484 aa
XP_057766598.1
516 aa
N
1
258
516
UDPGT
C
PF00201 UDPGT 303-482 aa
XP_057766599.1
512 aa
N
1
256
512
UDPGT
C
PF00201 UDPGT 299-478 aa
XP_057766600.1
505 aa
N
1
252
505
UDPGT
C
PF00201 UDPGT 292-471 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057766594.1 Pfam PF00201 UDPGT Family 329 508 3.2e-18 66.6 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase
XP_057766595.1 Pfam PF00201 UDPGT Family 325 504 3.1e-18 66.6 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase
XP_057766596.1 Pfam PF00201 UDPGT Family 317 496 3e-18 66.6 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase
XP_057766597.1 Pfam PF00201 UDPGT Family 305 484 2.9e-18 66.7 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase
XP_057766598.1 Pfam PF00201 UDPGT Family 303 482 2.8e-18 66.7 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase
XP_057766599.1 Pfam PF00201 UDPGT Family 299 478 2.8e-18 66.8 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase
XP_057766600.1 Pfam PF00201 UDPGT Family 292 471 2.7e-18 66.8 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA
XM_057910612.1
AACCAACACGTTACTTTTTACTACTTCATTAAATCTCGTTGACAAATACATCCTATTCTTTTCTTCCATCTCACTCATCTTGGTTTTCATCAATCTATTTTCTTCACCTCCAAGTCAAGAATGTTCACACATTTGTCATGCTGTATTGCGTCCACACACGCAAACACGTACGCGTGTGTGGAGAAGAACATATATATATAGCAGTCAAGAATTGTAAAGAATAGAAAAATTAAGCAAGAAATGGGAGGTGCAAGTGCAAC...
XM_057910611.1
AACCAACACGTTACTTTTTACTACTTCATTAAATCTCGTTGACAAATACATCCTATTCTTTTCTTCCATCTCACTCATCTTGGTTTTCATCAATCTATTTTCTTCACCTCCAAGTCAAGAATGTTCACACATTTGTCATGCTGTATTGCGTCCACACACGCAAACACGTACGCGTGTGTGGAGAAGAACATATATATATAGCAGTCAAGAATTGTAAAGAATAGAAAAATTAAGCAAGAAATGGGAGGTGCAAGTGCAAC...

CDS

7 records

下载 CDS FASTA
LOC130987053
ATGGGAGGTGCAAGTGCAACAACAGATATATTGGTGCTGCCATTTTTCGGACAAGGCCATCTCTTTCCATGTGCTGAGCTCTGCAAACACTTATCCTCTCACAACTGCAACTCAATCTTCATCATCCCTTCTCATCTCTCCTCCTCCATTCCTTCCGATCTCCCCCACCACCCTTCAGTCGAAATCGTCCAAATCGAATCATCGTCTTCGTCCCCTCCGCCGGAGACGACACTGCCACCGGATGCTTCCGATGGAGATTG...
LOC130987053
ATGGGAGGTGCAAGTGCAACAACAGATATATTGGTGCTGCCATTTTTCGGACAAGGCCATCTCTTTCCATGTGCTGAGCTCTGCAAACACTTATCCTCTCACAACTGCAACTCAATCTTCATCATCCCTTCTCATCTCTCCTCCTCCATTCCTTCCGATCTCCCCCACCACCCTTCAGTCGAAATCGTCCAAATCGAATCATCGTCTTCGTCCCCTCCGCCGGAGACGACACTGCCACCGGATGCTTCCGATGGAGATTG...

Protein

7 records

下载 Protein FASTA
XP_057766594.1
MGGASATTDILVLPFFGQGHLFPCAELCKHLSSHNCNSIFIIPSHLSSSIPSDLPHHPSVEIVQIESSSSSPPPETTLPPDASDGDWSRPGTKPGLHHHHQLAQGIESFLSERYEKVRPAFVVMDVMMSWTKDIFKKANIPIVSFFTSGACSAAMEYAAWKAHVENIGPDQAQKLPGLPESMALSYSDTKRQDRRRHEHGGGRGPRGGRGPRGRGHRGGDGSRGHRGGGGDGGGDGSRGHRGGDRDGGGGRGPRESTRWM...
XP_057766595.1
MGGASATTDILVLPFFGQGHLFPCAELCKHLSSHNCNSIFIIPSHLSSSIPSDLPHHPSVEIVQIESSSSSPPPETTLPPDASDGDWSRPGTKPGLHHHHQLAQGIESFLSERYEKVRPAFVVMDVMMSWTKDIFKKANIPIVSFFTSGACSAAMEYAAWKAHVENIGPDQAQKLPGLPESMALSYSDTKRQDRRRHEHGGGRGPRGGRGPRGRGHRGGDGSRGHRGGGGDGGGDGSRGHRGGGGGRGPRESTRWMDETE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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