当前解析结果
SmilChr05G003561| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003561 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003561 |
| 描述 | MOB kinase activator-like 1A |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 47535051 - 47539032 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130987062 |
|---|---|
| GeneID | 130987062 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987062 |
| 原始查询 | SmilChr05G003561 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | MOB kinase activator-like 1A |
| 产物 | MOB kinase activator-like 1A |
| Arabidopsis | AT5G45550 (MOB1-like)Mob1/phocein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834591] identity=89.9; qcov=1.01; evalue=1.41e-82; confidence=high |
| Rice | Os03g0577200- identity=89.8; qcov=1; evalue=9.32e-84; confidence=high |
| GO | GO:0001934 (positive regulation of protein phosphorylation); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0007165 (signal transduction); GO:0030295 (protein kinase activator activity) |
| KEGG | smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF03637 (Mob1_phocein) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987062 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057766616.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057766617.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057766616.1 |
| 4 | Cytoplasmic vesicle | 细胞质囊泡 | 0.20000 | XP_057766616.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766617.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:47537974 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,B35,B46,B53 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057766616.1PF03637
Mob1_phocein 34-204 aa
XP_057766617.1PF03637
Mob1_phocein 1-118 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057766616.1 |
Pfam | PF03637 |
Mob1_phocein | Family | 34 | 204 | 8.7e-83 | 277.2 | Mob1/phocein family |
XP_057766617.1 |
Pfam | PF03637 |
Mob1_phocein | Family | 1 | 118 | 4.7e-52 | 177.2 | Mob1/phocein family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。