当前解析结果
SmilChr05G003565| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003565 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003565 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003565 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 47595818 - 47596880 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987065 |
|---|---|
| GeneID | 130987065 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987065 |
| 原始查询 | SmilChr05G003565 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987065 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057766629.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057766629.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057766629.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057766629.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766629.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:47596344 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B23,B55,B98,C32,C68 |
Chr5:47596348 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,B35,C45 |
Chr5:47596350 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B114,C11,C66,C69 |
Chr5:47596351 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B18,B37 |
Chr5:47596359 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B126,B138,B70,C60 |
Chr5:47596398 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A4,B69 |
Chr5:47596405 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B63,B93 |
Chr5:47596411 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B120,B129,B91,C36,C6 |
Chr5:47596438 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 8 | B16,B33,B69,B73,B95,C46,C67,C9 |
Chr5:47596487 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B111 |
Chr5:47596592 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 24 | A10,A11,A8,B122,B124,B133,B33,B35,B44,B53,B55,B66,B71,B87,B93,C22,C43,C53,C57,C62,C68,C80,C9,D4 |
Chr5:47596596 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B63,B93,C55 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。