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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003567`

染色体: Chr05 坐标: 47609291-47610336 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003567`
名称	SmilChr05G003567
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit A-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47609291 - 47610336 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026040`
GeneID	`131026040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026040`
原始查询	`SmilChr05G003567`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit A-like
产物	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit A-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0776800` (RPA1A) - identity=25.5; qcov=0.863; evalue=8e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811799.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057811799.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057811799.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811799.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811799.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47609649`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	98	A10,A14,A16,A19,A20,A23,A4,A6,B10,B108,B109,B11,B111,B115,B117,B12,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B132,B133,B134,B137,B14,B17,B18,B2,B23,B26,B29,B36,B4,B40,B42,B43,B46,B47,B5,B53,B55,B57,B6,B61,B62,B64,B66,B67,B69,B71,B74,B76,B77,B78,B79,B83,B84,B88,B9,B95,B99,C14,C15,C17,C19,C22,C23,C25,C26,C27,C31,C33,C37,C39,C40,C43,C49,C53,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C71,C74,C75,C83,C85,C86,C9,D3,D5
`Chr5:47609795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C24
`Chr5:47609816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr5:47609826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:47609832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr5:47609834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:47609836`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	31	A1,B100,B113,B12,B124,B13,B14,B30,B57,B59,B72,B76,B88,B90,B92,B94,C16,C19,C20,C21,C24,C32,C41,C42,C47,C55,C61,C68,C7,C70,C79
`Chr5:47610002`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B83,C18,C2,C45,C48
`Chr5:47610002`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B83,C18,C2,C45,C48
`Chr5:47610006`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B63,B85,B86,B87,B9,C33,C58,C60,C82,C85,D1,D11,D6
`Chr5:47610195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr5:47610264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B65

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955816.1
ATGAAAGAAGATGCTGTTGTTCAGATTAGGCATTTCTTCGTCAGAAACAACAACTTCATCAGGAACAAGACTGTTAACAATCCATATAGGATTGTGTTGTTCCCAAAAAGTCAGATGTCAGCATGCATTGATCCTGAATTTCCTATTCACAAATTCATTTTCAAGGATTTCAAAGAGATAAATGCTATTGAAGATGCTAATGAGGAAGTGCTGTTTGATATTATTGGAGTGTTGGTGGGAAAGGGGTTTATTAAAGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026040
ATGAAAGAAGATGCTGTTGTTCAGATTAGGCATTTCTTCGTCAGAAACAACAACTTCATCAGGAACAAGACTGTTAACAATCCATATAGGATTGTGTTGTTCCCAAAAAGTCAGATGTCAGCATGCATTGATCCTGAATTTCCTATTCACAAATTCATTTTCAAGGATTTCAAAGAGATAAATGCTATTGAAGATGCTAATGAGGAAGTGCTGTTTGATATTATTGGAGTGTTGGTGGGAAAGGGGTTTATTAAAGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811799.1
MKEDAVVQIRHFFVRNNNFIRNKTVNNPYRIVLFPKSQMSACIDPEFPIHKFIFKDFKEINAIEDANEEVLFDIIGVLVGKGFIKDQNNAKLIELVLEDSSHNKMYCTLWKEYVDSFRMQATNEQNMLPIVIIQFCRPTLYKGKGDVRVCTSRNVSRLFVNCDIEEITKFRELIVSYTCIGA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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