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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003570`

染色体: Chr05 坐标: 47652987-47657700 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003570`
名称	SmilChr05G003570
描述	uncharacterized SmilChr05G003570
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47652987 - 47657700 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987069`
GeneID	`130987069`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987069`
原始查询	`SmilChr05G003570`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821971]; symbol=AT3G23880; hit=AT3G23880; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821971]; symbol=AT3G23880; hit=AT3G23880; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G23880` (AT3G23880) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821971] identity=24.5; qcov=0.668; evalue=1.67e-08; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987069

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766637.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057766637.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766637.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766637.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766637.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47656176`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B122,C31
`Chr5:47656176`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B122,C31
`Chr5:47656181`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B122,C31
`Chr5:47656181`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B122,C31
`Chr5:47656182`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B122,C31
`Chr5:47656182`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B122,C31
`Chr5:47656192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C31,C67
`Chr5:47656341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C72
`Chr5:47656344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B54,B95
`Chr5:47656412`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B123,C46,C87
`Chr5:47656412`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B123,C46,C87
`Chr5:47656492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C8,C9,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766637.1

367 aa

184

367

FBA_1

PF07734 FBA_1 37-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766637.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	37	322	6.9e-13	49.0	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910654.1
CGTCTCAAATACTTTTTATAACAAAAAGATAAAATTAGGGCTGCTGCGTTTCGGCGAATTTTGGTTGCCCCTTGCTTGAACCAAAACGTGATCTTCGATTCGATTGCACAGTACAAGACGAGGAATGGCTGGGTTTGCTGTTGTTAGTAAAGATGAAAGAAACAAGTATCGTTTATCAGTTATGTGTCCAGTAGAGCTGTCTGTATCTGAAAATCTCAACTTTAATTCCTTTAAAAAGCATGATACAGTTCTTGGTGGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987069
ATGGCTGGGTTTGCTGTTGTTAGTAAAGATGAAAGAAACAAGTATCGTTTATCAGTTATGTGTCCAGTAGAGCTGTCTGTATCTGAAAATCTCAACTTTAATTCCTTTAAAAAGCATGATACAGTTCTTGGTGGTAGTTGTGGTGGATTGTTGTATTTCCATGGCAATTATGGCCACAGTTTCATTTGTAACTTAAAAACTAACCAAATGAAAGTCCTTACTCCGCCCAATTTCTTACCCCCTCCAAATGATGGCATTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766637.1
MAGFAVVSKDERNKYRLSVMCPVELSVSENLNFNSFKKHDTVLGGSCGGLLYFHGNYGHSFICNLKTNQMKVLTPPNFLPPPNDGIVTYSGLGYDAKSGDLKVIRRYVQHYIRKIDETDGGTGYHGCKSHTELYSSKDNEWKKIKHAVGCVAAGVGVSVEETGSCYWVVVVDPSEQKIKEYLERHSITDPWAPHVLSFDFATDSFELIPLPATTIRAYFLLCKVRGSIGALAYWKSCSSELCIKAFVLEGTSWGVLCDDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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