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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003581`

染色体: Chr05 坐标: 47839889-47843151 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003581`
名称	SmilChr05G003581
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase B120
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47839889 - 47843151 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987078`
GeneID	`130987078`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987078`
原始查询	`SmilChr05G003581`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase B120
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase B120
Arabidopsis	`AT4G21390` (B120) S-locus lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827891] identity=40.3; qcov=0.994; evalue=3.87e-180; confidence=medium
Rice	`Os01g0783800` - identity=40.8; qcov=1.04; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF01453 (B_lectin); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08276 (PAN_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987078

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766654.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766654.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766654.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766654.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766654.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47840061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:47840274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr5:47840298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:47840331`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	32	A11,A25,A4,B101,B107,B115,B121,B136,B20,B21,B29,B40,B44,B50,B52,B54,B58,B70,B73,B89,B97,C12,C32,C36,C46,C48,C5,C58,C68,C77,C87,D8
`Chr5:47840729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr5:47840735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C54
`Chr5:47840829`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B45
`Chr5:47840829`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B45
`Chr5:47840913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D7
`Chr5:47840913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:47841099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D2
`Chr5:47841157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B33,B69,C1,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766654.1

809 aa

404

809

B_lectin

PAN_2

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF01453 B_lectin 78-169 aa PF08276 PAN_2 322-383 aa PF00069 Pkinase 493-692 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 494-760 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766654.1`	Pfam	`PF01453`	B_lectin	Repeat	78	169	7.1e-26	91.4	D-mannose binding lectin
`XP_057766654.1`	Pfam	`PF08276`	PAN_2	Domain	322	383	2.2e-11	44.4	PAN-like domain
`XP_057766654.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	493	692	4.8e-43	148.2	Protein kinase domain
`XP_057766654.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	494	760	5.1e-46	157.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910671.1
ACTACATACATACCAAACACCATACCATATATCTTTATAAAATAATAATATCTGGTATCGGCAGTCTCATCAATTATATAATTGAAATGAATATTCTTGCAGCCATGCATGCAAATCCAGTAGCAATCTCAATAATTTTGGCGGCGTTGCTCATGGCTGAGAAATCCATTGGAGCAGGAGACACGCTCTCACAAAGGGAATCTCTCACAGGAAACCAAACATTAACCTCAAAGAGTGGAACGTTTGAAATGGGTTTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987078
ATGAATATTCTTGCAGCCATGCATGCAAATCCAGTAGCAATCTCAATAATTTTGGCGGCGTTGCTCATGGCTGAGAAATCCATTGGAGCAGGAGACACGCTCTCACAAAGGGAATCTCTCACAGGAAACCAAACATTAACCTCAAAGAGTGGAACGTTTGAAATGGGTTTCTTCCCAACATCCACAAACAGATTCTACCTAAGCATTCGTTACACCCAGATTCCAAAACCTCTAGTTTGGATCGCAAACAGAGAAAATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766654.1
MNILAAMHANPVAISIILAALLMAEKSIGAGDTLSQRESLTGNQTLTSKSGTFEMGFFPTSTNRFYLSIRYTQIPKPLVWIANRENPLPDPTTCKLQISSNGDLQVYNGSDIFWSTSSSSSTSPESVVAVLLDDGNLILRDERQGIIMTWQSFHHPTDTWLPGATLSIGQRLVSWTSNEDPSPGMFSAEISPESTIVFKWRGSAVYWESGSLEYADQWGLDDWLVFQPNEKLGNSWRLDNAPSFPTPVFSMLVMSVEGRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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