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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003582`

染色体: Chr05 坐标: 47851539-47854876 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003582`
名称	SmilChr05G003582
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g03230
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47851539 - 47854876 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987080`
GeneID	`130987080`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987080`
原始查询	`SmilChr05G003582`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g03230
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g03230
Arabidopsis	`AT4G03230` (AT4G03230) G-type lectin S-receptor-like Serine/Threonine-kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828018] identity=40.9; qcov=0.984; evalue=3.54e-174; confidence=medium
Rice	`Os01g0783800` - identity=39.8; qcov=1.04; evalue=7.01e-180; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF01453 (B_lectin); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08276 (PAN_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987080

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766657.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766657.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766657.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766657.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766657.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47851714`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	48	A11,A21,A22,A5,A9,B1,B101,B107,B112,B115,B119,B121,B138,B15,B17,B2,B21,B23,B29,B32,B37,B40,B44,B45,B48,B54,B66,B73,B74,B77,B87,B89,B97,B98,C12,C22,C26,C3,C36,C48,C61,C64,C66,C77,C8,C87,D6,D8
`Chr5:47851806`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B132,D4
`Chr5:47851806`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B132,D4
`Chr5:47851810`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B132,D4
`Chr5:47851810`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B132,D4
`Chr5:47851889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B72,B99,D10
`Chr5:47851941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	74	A14,A15,A16,A23,A3,A4,A8,A9,B1,B100,B101,B104,B108,B111,B115,B126,B127,B128,B13,B130,B132,B135,B138,B15,B2,B25,B26,B27,B3,B31,B34,B35,B37,B38,B39,B4,B45,B46,B48,B49,B53,B60,B63,B66,B68,B77,B79,B88,B98,C11,C15,C16,C17,C27,C28,C33,C36,C37,C4,C46,C49,C52,C57,C61,C64,C66,C68,C69,C8,C80,C84,C85,D4,D5
`Chr5:47851945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:47852093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A21,B59
`Chr5:47852143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	62	A11,A15,A23,A3,A4,A8,B1,B101,B102,B108,B11,B111,B115,B123,B127,B128,B130,B135,B136,B138,B15,B17,B2,B25,B27,B30,B34,B35,B37,B39,B45,B46,B48,B49,B53,B59,B66,B68,B72,B77,B86,B99,C11,C14,C16,C30,C32,C33,C36,C37,C46,C57,C61,C64,C66,C68,C69,C8,C85,D11,D4,D5
`Chr5:47852166`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A11,B101
`Chr5:47852166`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A11,B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766657.1

823 aa

412

823

B_lectin

PAN_2

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF01453 B_lectin 76-169 aa PF08276 PAN_2 335-392 aa PF00069 Pkinase 505-705 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 506-775 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766657.1`	Pfam	`PF01453`	B_lectin	Repeat	76	169	2.4e-23	83.3	D-mannose binding lectin
`XP_057766657.1`	Pfam	`PF08276`	PAN_2	Domain	335	392	4.5e-11	43.4	PAN-like domain
`XP_057766657.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	505	705	1.3e-41	143.5	Protein kinase domain
`XP_057766657.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	506	775	8.4e-46	157.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910674.1
ACAGAAGAAATATCAAATATTTGGCTTATTGACTTGCACTGGACTCAATTTTCTCTCTCGAGATCCTCATTCCAACTAAATTCTAGGTCTGTGCAAACATTCACAACTAGATTATAATAATATCTGGTTTTGGCAGTTTCTCCGTCCATCAATTATACCAACCAACCAAATGAATGTTGCAGCCATGCATGGAAATCTAGTAATAGTTGTGGTTGTGTTGTTGATGGCTGAAAAATCCGTTAATGGAGCAGGTGACACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987080
ATGAATGTTGCAGCCATGCATGGAAATCTAGTAATAGTTGTGGTTGTGTTGTTGATGGCTGAAAAATCCGTTAATGGAGCAGGTGACACCCTCACAAAAGGAGAATCTCTTACAGGAAGCCAGACTTTAACCTCAAAGGGTGGAACGTTTGAGTTGGGGTTCTTCCACACATCCACAGACAGATTCTACCTTAGCATTCGTTACACCCAGATTGAACCAAAGCCTCTGGTTTGGGTCGCTAACAGAGATAAACCTTTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766657.1
MNVAAMHGNLVIVVVVLLMAEKSVNGAGDTLTKGESLTGSQTLTSKGGTFELGFFHTSTDRFYLSIRYTQIEPKPLVWVANRDKPLPDATAANLQIASNGDLQLHYGRDLFWSTSTSAESVAAVLSDDGNLIVRDESRPEKKKLWQSFDQPTHAWLPGATLGGARRLVSWKSDEDPSAGMFSAEMSSESKVVLKWNESAVYWESESYEPGNQFGFDAQQLNSLSIRFEVEKQYVRLENTLAIMINDTFRLDFSMLVMDHR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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