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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003613`

染色体: Chr05 坐标: 48226675-48229866 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003613`
名称	SmilChr05G003613
描述	ubiquinol oxidase 2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	48226675 - 48229866 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987104`
GeneID	`130987104`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987104`
原始查询	`SmilChr05G003613`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquinol oxidase 2, mitochondrial-like
产物	ubiquinol oxidase 2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G32350` (AOX1D) alternative oxidase 1D [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840127] identity=70.2; qcov=0.843; evalue=1.05e-152; confidence=high
Rice	`Os04g0600200` (AOX1A) - identity=74.3; qcov=0.749; evalue=1.69e-147; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0009916 (alternative oxidase activity); GO:0010230 (alternative respiration)
KEGG	-
Pfam	PF01786 (AOX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987104

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057766704.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057766704.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057766704.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766704.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766704.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:48226944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:48227038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C2,C25
`Chr5:48227047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr5:48227053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B122
`Chr5:48227078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B139,D4
`Chr5:48227103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:48227146`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr5:48227146`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr5:48227164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:48227197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:48227278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:48227293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766704.1

368 aa

184

368

AOX

PF01786 AOX 127-317 aa

XP_057766705.1

357 aa

178

357

AOX

PF01786 AOX 127-317 aa

XP_057766706.1

338 aa

169

338

AOX

PF01786 AOX 127-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766704.1`	Pfam	`PF01786`	AOX	Domain	127	317	3.6e-79	266.1	Alternative oxidase
`XP_057766705.1`	Pfam	`PF01786`	AOX	Domain	127	317	3.4e-79	266.2	Alternative oxidase
`XP_057766706.1`	Pfam	`PF01786`	AOX	Domain	127	319	1.6e-79	267.2	Alternative oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910722.1
TACGGCAAGAACAATAGAAACACAAGTTATTTCTAGACACCTTCATATGTCAACTCCAAGACTTTTACAAAACAAACGCGAATCCAAGGCCACACTACATATATAAGCATCAACCCCTAATTAATTTCAAGAGACACCAAATTCAAAACCCCAATCAAACAAGACCAAACCTCATATCTCATTCCTCAACTTCAATTTCTACGCAATGAGCCGTCGTGCCGTCTTGCAAGTTTCCAAGTTGCTCGACAAACAGTCTCGAA...

XM_057910721.1
TACGGCAAGAACAATAGAAACACAAGTTATTTCTAGACACCTTCATATGTCAACTCCAAGACTTTTACAAAACAAACGCGAATCCAAGGCCACACTACATATATAAGCATCAACCCCTAATTAATTTCAAGAGACACCAAATTCAAAACCCCAATCAAACAAGACCAAACCTCATATCTCATTCCTCAACTTCAATTTCTACGCAATGAGCCGTCGTGCCGTCTTGCAAGTTTCCAAGTTGCTCGACAAACAGTCTCGAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130987104
ATGAGCCGTCGTGCCGTCTTGCAAGTTTCCAAGTTGCTCGACAAACAGTCTCGAAACACAACGGCTATATTCAATGGTGCTACCAAAATTTCAAAAAACTCTACATTCGCAAATTATGAAATCTTTAGAGTAGCTCCAGTGCTCGGGGGTAGACATCAGAACAACACGATCAGCTCAGTATCAGGGGAGACTAAAGAAGAAAAGACAAAATTAGGGCTCGGTGGCGAAAATGTAAAGAATGATCAAGGTGGCAAGAGCGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057766704.1
MSRRAVLQVSKLLDKQSRNTTAIFNGATKISKNSTFANYEIFRVAPVLGGRHQNNTISSVSGETKEEKTKLGLGGENVKNDQGGKSVVSSYWGVATPQVRKADGSPWRWNCFRPWETYTADTTIDVKKHHEAKTFMDKFAYWTVQSLKYPTHLFFQRRHMCHAMLLETVAAVPGMVGGMMLHLKSLRRFEQSGGWIKALLEEAENERMHLMTFLELSQPKWTERALVIAVQGVFFNAYFAAYLLSPKLAHRIVGYLEEEA...

XP_057766705.1
MSRRAVLQVSKLLDKQSRNTTAIFNGATKISKNSTFANYEIFRVAPVLGGRHQNNTISSVSGETKEEKTKLGLGGENVKNDQGGKSVVSSYWGVATPQVRKADGSPWRWNCFRPWETYTADTTIDVKKHHEAKTFMDKFAYWTVQSLKYPTHLFFQRRHMCHAMLLETVAAVPGMVGGMMLHLKSLRRFEQSGGWIKALLEEAENERMHLMTFLELSQPKWTERALVIAVQGVFFNAYFAAYLLSPKLAHRIVGYLEEEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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