Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003624`

染色体: Chr05 坐标: 48520529-48527121 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003624`
名称	SmilChr05G003624
描述	protein GET4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	48520529 - 48527121 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987116`
GeneID	`130987116`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987116`
原始查询	`SmilChr05G003624`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein GET4
产物	protein GET4
Arabidopsis	`AT5G63220` (AT5G63220) golgi-to-ER traffic-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836442] identity=63.19; qcov=0.994; evalue=6.05e-155; confidence=high
Rice	`Os01g0164700` - identity=54.43; qcov=0.242; evalue=1.65e-19; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0045048 (protein insertion into ER membrane)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04190 (GET4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987116

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766721.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766721.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057766722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:48521788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C5,C77,D10
`Chr5:48526552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:48526779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766721.1

350 aa

175

350

GET4

PF04190 GET4 48-321 aa

XP_057766722.1

327 aa

164

327

GET4

PF04190 GET4 48-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766721.1`	Pfam	`PF04190`	GET4	Repeat	48	321	3.6e-68	230.8	Golgi to ER traffic protein 4
`XP_057766722.1`	Pfam	`PF04190`	GET4	Repeat	48	321	2.3e-68	231.4	Golgi to ER traffic protein 4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910739.1
TTGCTCACTCTACCCAAAAGAAAAAGTGGAGTAAAATTAGATGAAAAAAACATTTGACGAAAACAGCTGAATTTCAATCCTTCGTTGTCCCGTCTTGTTCGCCGCATCTGCCTCTTAATCCCATTCGAGATCCATCTTCACCTTCTCTGCCTCCATTCCCCGCCCGCCCATCTCCCTCCGCCGCCATAACTCCGCCGCACCACACTAGCCTCTCGCGCTTCTCTTGGCTTCGCCTTAGCTCGCCATATTCTGTCCATGCT...

XM_057910738.1
AAAATTAGATGAAAAAAACATTTGACGAAAACAGCTGAATTTCAATCCTTCGTTGTCCCGTCTTGTTCGCCGCATCTGCCTCTTAATCCCATTCGAGATCCATCTTCACCTTCTCTGCCTCCATTCCCCGCCCGCCCATCTCCCTCCGCCGCCATAACTCCGCCGCACCACACTAGCCTCTCGCGCTTCTCTTGGCTTCGCCTTAGCTCGCCATATTCTGTCCATGCTTGGACGTATTTCTTCCTCCCGGAAGCAGAGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080391.1_cds_XP_057766722.1_29448
ATGTCACGAGAAAGGGCCAGGCGTGTCGCACTAGCACCAGCTGAAGAGACTATTGAGAAGATTAAAAAAGTTGTAGAGGAAGGCAACTTCTATGGCGCTCAACAAATGTATAAGTCTCTTGGTTCTAGGTATGCTTCAGCCAACAGGTACTTAGAAGCCTTGGATATTTTTCATTCAGGTGCTTGCATACAATTAGTGAATGGACAGGTTACATGTGGTACTGAGCTTGCTGTCTTGTTCGTGGAAAATCTTGTTAAAGG...

lcl|NC_080391.1_cds_XP_057766721.1_29449
ATGTCACGAGAAAGGGCCAGGCGTGTCGCACTAGCACCAGCTGAAGAGACTATTGAGAAGATTAAAAAAGTTGTAGAGGAAGGCAACTTCTATGGCGCTCAACAAATGTATAAGTCTCTTGGTTCTAGGTATGCTTCAGCCAACAGGTACTTAGAAGCCTTGGATATTTTTCATTCAGGTGCTTGCATACAATTAGTGAATGGACAGGTTACATGTGGTACTGAGCTTGCTGTCTTGTTCGTGGAAAATCTTGTTAAAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766721.1
MSRERARRVALAPAEETIEKIKKVVEEGNFYGAQQMYKSLGSRYASANRYLEALDIFHSGACIQLVNGQVTCGTELAVLFVENLVKGKIPYDDDTLDRIRQIYKKFPRISVPQNLDLADDVDMQQLAEALGAAKTRAEGCSTFLRAAIKWSTEFGGQRNGSPEIHDMLADYLYTESPELDMSKVTYHFVRGKNPKKFASTLVNFMGKCYPGEDDLAVARAVLMYLAQGNLRDAIILMDEIKKQVQSQGVNLPRSDLMQFT...

XP_057766722.1
MSRERARRVALAPAEETIEKIKKVVEEGNFYGAQQMYKSLGSRYASANRYLEALDIFHSGACIQLVNGQVTCGTELAVLFVENLVKGKIPYDDDTLDRIRQIYKKFPRISVPQNLDLADDVDMQQLAEALGAAKTRAEGCSTFLRAAIKWSTEFGGQRNGSPEIHDMLADYLYTESPELDMSKVTYHFVRGKNPKKFASTLVNFMGKCYPGEDDLAVARAVLMYLAQGNLRDAIILMDEIKKQVQSQGVNLPRSDLMQFT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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