当前解析结果
SmilChr05G003654| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003654 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003654 |
| 描述 | proline-rich receptor-like protein kinase PERK14 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 49174159 - 49175537 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131026068 |
|---|---|
| GeneID | 131026068 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026068 |
| 原始查询 | SmilChr05G003654 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | proline-rich receptor-like protein kinase PERK14 |
| 产物 | proline-rich receptor-like protein kinase PERK14 |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026068 |
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五折投票;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,投票比例不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| Rank | 定位位置 | 中文 | 五折投票比例 | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811826.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057811826.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057811826.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057811826.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:49174223 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,B59,C40,C54 |
Chr5:49174231 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B111,D2 |
Chr5:49174232 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr5:49174246 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B111,D2 |
Chr5:49174302 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D2 |
Chr5:49174317 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C53,C9 |
Chr5:49174363 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A19 |
Chr5:49174369 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,C11,D1 |
Chr5:49174378 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B16,B32,B33,C50,C58 |
Chr5:49174518 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B113 |
Chr5:49174653 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C64 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。