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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003661`

染色体: Chr05 坐标: 49329933-49333406 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003661`
名称	SmilChr05G003661
描述	uncharacterized zinc finger CCHC domain-containing protein At4g19190-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	49329933 - 49333406 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987145`
GeneID	`130987145`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987145`
原始查询	`SmilChr05G003661`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827658]; symbol=AT4G19190; hit=AT4G19190; species=arabidopsis; confidence=high
产物	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827658]; symbol=AT4G19190; hit=AT4G19190; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G19190` (AT4G19190) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827658] identity=72.1; qcov=0.703; evalue=7.79e-155; confidence=high
Rice	`Os06g0708900` - identity=73.4; qcov=0.189; evalue=3.15e-35; confidence=weak
GO	GO:0003714 (transcription corepressor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF10197 (Cir_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987145

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766757.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057766757.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.80000	`XP_057766757.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057766757.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057766757.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:49330160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:49330268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr5:49330330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:49331712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B13
`Chr5:49332044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766757.1

418 aa

209

418

Cir_N

PF10197 Cir_N 39-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766757.1`	Pfam	`PF10197`	Cir_N	Domain	39	73	5.9e-10	39.9	N-terminal domain of CBF1 interacting co-repressor CIR

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910774.1
GTATGCAAAATTTTACATAAAATACTTAAGAGTGCATCTAGAGGGTTAGGGAGAAATTTATCCTTGCAACTTTTATAGCGGCAAGGTGAACGATAAGCAGTAATCACATACAAACGCGCAGAACCACGGCCACGTGAGCTCGGCAAGAACCGGATTCCAATCATGGAGGAGGGCGCCGGAGGGTTCCGAGCCGGCAACAAGGACAAAGGCGGCGAAGTCGACTACAAGACGAAGGCCGGGACGGCGTGGTCGCACTCGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987145
ATGGAGGAGGGCGCCGGAGGGTTCCGAGCCGGCAACAAGGACAAAGGCGGCGAAGTCGACTACAAGACGAAGGCCGGGACGGCGTGGTCGCACTCGTTCCTCAACCAGAAGCCCTGGCACCCGCTCTCCTACCCAAACCAGCGCCGCAAATGGATCGCCGAGCAAACCCACTCGCAAAATCAGCGCCGCGCCGAGGAGGTCGCGCGCGAGTATGCTCAACAACAGGATTTTCTTCGGCAGACTGCACTTCTTTCAAATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766757.1
MEEGAGGFRAGNKDKGGEVDYKTKAGTAWSHSFLNQKPWHPLSYPNQRRKWIAEQTHSQNQRRAEEVAREYAQQQDFLRQTALLSNKEKEKLEMMQAVSFLYVKPPGYNAESAKAAEIADEKRKLEQSLEEGSSSMKTENGPSAGEKKKQAPKDVFGRALPTEEQFEVLKNAPKLDTGVAGRAKPFGVEIRNVKCLRCGNYGHQSGDRECPLKDAIMPNEESRLKRDDPLTAILAQTDASEPLKWELKQQPGMSPPRGGF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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