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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003676`

染色体: Chr05 坐标: 49750105-49750792 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003676`
名称	SmilChr05G003676
描述	uncharacterized SmilChr05G003676
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	49750105 - 49750792 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026075`
GeneID	`131026075`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026075`
原始查询	`SmilChr05G003676`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=26.9; qcov=0.564; evalue=1.26e-09; confidence=low
Rice	`Os01g0595300` - identity=27.9; qcov=0.673; evalue=4.97e-13; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026075

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057811833.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811833.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811833.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811833.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811833.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:49750137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C80
`Chr5:49750164`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B46
`Chr5:49750164`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B46
`Chr5:49750306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	53	A14,A18,A23,A6,A9,B101,B105,B110,B115,B117,B124,B128,B137,B138,B18,B19,B27,B38,B39,B40,B46,B48,B53,B57,B60,B61,B64,B65,B7,B71,B78,B79,B9,B91,B98,C11,C23,C33,C40,C41,C43,C49,C57,C59,C60,C62,C67,C69,C71,C73,C74,C82,C83
`Chr5:49750317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C80
`Chr5:49750325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:49750331`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	103	A14,A16,A18,A23,A25,A4,A5,A6,A8,A9,B10,B101,B104,B105,B110,B115,B117,B118,B121,B124,B128,B132,B136,B137,B138,B140,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B27,B28,B30,B38,B39,B40,B44,B45,B46,B47,B48,B52,B53,B56,B57,B60,B61,B64,B65,B68,B7,B70,B71,B73,B75,B78,B79,B86,B89,B9,B91,B96,B98,C1,C11,C16,C23,C24,C26,C3,C33,C34,C38,C39,C40,C41,C43,C46,C48,C49,C5,C54,C56,C57,C58,C59,C60,C62,C67,C69,C71,C73,C74,C76,C77,C8,C82,C83,C87,D11,D8
`Chr5:49750340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C43
`Chr5:49750418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C43
`Chr5:49750435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr5:49750475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr5:49750481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811833.1

165 aa

165

SWIM

PF04434 SWIM 76-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811833.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	76	114	3.3e-06	27.2	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955850.1
ATGTCGGCTATGGCTCAATTGAAGCCGGCGGCGTACGGGAAGTTGATGCGCGTAGGCCCTGAGAAGCAATCAGGATGGTTCTGGAGCAGTGGTTCAATGACAGACTCGCAGTCTGCGGAAGAGAGCGAGGATCTTCTTACTCCAGAGGCAACACAGAAGATAAGTGCGGAGATCTCAAAGAGTCGTCGTTACACTGCGAAGAGGACCTCCGAGAGAAAATACAGGGTTCGTGCTGGTGATCGTCGCTTCATGGTTGACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026075
ATGTCGGCTATGGCTCAATTGAAGCCGGCGGCGTACGGGAAGTTGATGCGCGTAGGCCCTGAGAAGCAATCAGGATGGTTCTGGAGCAGTGGTTCAATGACAGACTCGCAGTCTGCGGAAGAGAGCGAGGATCTTCTTACTCCAGAGGCAACACAGAAGATAAGTGCGGAGATCTCAAAGAGTCGTCGTTACACTGCGAAGAGGACCTCCGAGAGAAAATACAGGGTTCGTGCTGGTGATCGTCGCTTCATGGTTGACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811833.1
MSAMAQLKPAAYGKLMRVGPEKQSGWFWSSGSMTDSQSAEESEDLLTPEATQKISAEISKSRRYTAKRTSERKYRVRAGDRRFMVDLQAKSCECNEFDLDDMPCSHAIAAIIEANEPVEDYVEAYYKLSSLVQTYSGSVNHLLPLEHWEIPFEIATDIVLPNLSR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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