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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003678`

染色体: Chr05 坐标: 49828501-49829151 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003678`
名称	SmilChr05G003678
描述	uncharacterized SmilChr05G003678
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	49828501 - 49829151 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026077`
GeneID	`131026077`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026077`
原始查询	`SmilChr05G003678`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=27.3; qcov=0.509; evalue=2.18e-06; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=28.9; qcov=0.977; evalue=3.19e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026077

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811835.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811835.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811835.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811835.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811835.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:49828509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	66	A2,A23,A5,A7,B100,B105,B107,B123,B124,B127,B128,B130,B134,B15,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B26,B29,B31,B34,B38,B39,B4,B41,B43,B53,B55,B56,B58,B64,B67,B7,B73,B74,B83,B87,B88,B89,B93,B96,B99,C24,C25,C30,C45,C46,C48,C54,C58,C60,C62,C64,C66,C72,C75,C77,C78,C8,C83,C86,C87,C9
`Chr5:49828516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B133,C17,C84
`Chr5:49828522`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A10,A25,A4,B101,B136,B20,B21,B70,B96,C16,C24,C3,C46,C5,C58,D9
`Chr5:49828523`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A10,A25,A4,B101,B136,B20,B70,B96,C16,C24,C3,C46,C5,C58,D9
`Chr5:49828540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B123,B30
`Chr5:49828540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B30
`Chr5:49828550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B136,D9
`Chr5:49828551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C56
`Chr5:49828558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B94,C82,C86
`Chr5:49828575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B78,B98,C85
`Chr5:49828613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C66,D3
`Chr5:49828643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955852.1
ATGGCAAAGGCTTATGATAGAGTCGAGTGGAGTTTCCTTGAATCCATGTTATGTCAGCTTGGTTTCCATGTTTCGGTTGTCAACTTGATCATGCGCTGTGTTTCTTCGGTTTCTTTCCGCGCGTTCTTGTTAACGGTTTCCCCGGTGAGGTTTTCGAACCAAGCAGGGGACTCCGCCAGGGTGACCCTTTATCGCCTTTTCTTTTCTTGTTTTGTGCAGAAGCTCTCTCTGGCCTTCTTCGCCAAGCTGAAAATCAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026077
ATGGCAAAGGCTTATGATAGAGTCGAGTGGAGTTTCCTTGAATCCATGTTATGTCAGCTTGGTTTCCATGTTTCGGTTGTCAACTTGATCATGCGCTGTGTTTCTTCGGTTTCTTTCCGCGCGTTCTTGTTAACGGTTTCCCCGGTGAGGTTTTCGAACCAAGCAGGGGACTCCGCCAGGGTGACCCTTTATCGCCTTTTCTTTTCTTGTTTTGTGCAGAAGCTCTCTCTGGCCTTCTTCGCCAAGCTGAAAATCAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811835.1
MAKAYDRVEWSFLESMLCQLGFHVSVVNLIMRCVSSVSFRAFLLTVSPVRFSNQAGDSARVTLYRLFFSCFVQKLSLAFFAKLKIKDLFRELGFAALQPRISHLLFADDCIIFGRVNEKEVGVIGAILKKYEDVSGQQVNLSKFSISFSSGVLEETRNMLAAKLGVSCQGQNGVYLGIPSVVGRSKVEIFQMLVDRTRKKAKDWKRKFLSEREKQF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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