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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003690`

染色体: Chr05 坐标: 50028523-50029749 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003690`
名称	SmilChr05G003690
描述	late embryogenesis abundant protein 6-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50028523 - 50029749 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987218`
GeneID	`130987218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987218`
原始查询	`SmilChr05G003690`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late embryogenesis abundant protein 6-like
产物	late embryogenesis abundant protein 6-like
Arabidopsis	`AT1G32560` (AtLEA4-1) Late embryosis abundant protein, group 1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840150] identity=52.4; qcov=1.02; evalue=5.9e-23; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0009793 (embryo development ending in seed dormancy)
KEGG	-
Pfam	PF03760 (LEA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057766864.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057766864.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057766864.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766864.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766864.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50028767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:50028771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B10,B51,B58,C76
`Chr5:50028795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B119,C56,C65,C80
`Chr5:50028814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr5:50028827`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B101
`Chr5:50028827`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B101
`Chr5:50028868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:50028988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766864.1

124 aa

124

LEA_1

PF03760 LEA_1 1-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766864.1`	Pfam	`PF03760`	LEA_1	Domain	1	75	4.4e-21	75.9	Late embryogenesis abundant (LEA) group 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910881.1
TTTATCGATCATGCAATCAGCTAAACAGAAAGCCGCCGACGGCGCCGCCGTCGCCAAGGAGCACGTCGAAATCCTTAGAGCCAAAGCCCAAGAGAAGGCGGAGATAGCGGCGGCGCCGACCAAGGAAGGGAGAGAGATAGCTCATGAGCGGAGGAAAGCCAAGGAAGCTGAAGCCAAGATGAAGATGCACGCCGCCAAAGCCGACCACGCCGCCGACAAGCTGCACGCAGCCCAGCACGGCCTCTGCGGTCTCGGCTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987218
ATGCAATCAGCTAAACAGAAAGCCGCCGACGGCGCCGCCGTCGCCAAGGAGCACGTCGAAATCCTTAGAGCCAAAGCCCAAGAGAAGGCGGAGATAGCGGCGGCGCCGACCAAGGAAGGGAGAGAGATAGCTCATGAGCGGAGGAAAGCCAAGGAAGCTGAAGCCAAGATGAAGATGCACGCCGCCAAAGCCGACCACGCCGCCGACAAGCTGCACGCAGCCCAGCACGGCCTCTGCGGTCTCGGCTGCACCCACCCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766864.1
MQSAKQKAADGAAVAKEHVEILRAKAQEKAEIAAAPTKEGREIAHERRKAKEAEAKMKMHAAKADHAADKLHAAQHGLCGLGCTHPHHHHHGGGYQEPVVSSAFPPPAPAYPHGGYPPGWTAPK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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