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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003700`

染色体: Chr05 坐标: 50106331-50107753 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003700`
名称	SmilChr05G003700
描述	uncharacterized SmilChr05G003700
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50106331 - 50107753 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987207`
GeneID	`130987207`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987207`
原始查询	`SmilChr05G003700`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vitellogenin-2 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840036]; symbol=AT1G31460; hit=AT1G31460; species=arabidopsis; confidence=low
产物	vitellogenin-2 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840036]; symbol=AT1G31460; hit=AT1G31460; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G31460` (AT1G31460) vitellogenin-2 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840036] identity=34; qcov=1.15; evalue=1.44e-28; confidence=low
Rice	`Os06g0710900` - identity=35; qcov=0.469; evalue=1.98e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987207

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766838.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057766838.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766838.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766838.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766838.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50106741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C20,D5
`Chr5:50106764`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	65	A1,A10,A16,A2,A20,A3,A5,B104,B108,B110,B111,B119,B126,B128,B13,B133,B136,B137,B15,B16,B2,B22,B26,B31,B34,B37,B53,B56,B67,B75,B78,B80,B82,B87,B99,C11,C19,C2,C23,C24,C29,C30,C33,C41,C42,C43,C47,C49,C52,C56,C59,C63,C69,C7,C71,C72,C75,C76,C78,C86,C9,D1,D10,D3,D5
`Chr5:50106765`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	64	A1,A10,A16,A2,A20,A3,A5,B104,B108,B110,B111,B119,B126,B128,B13,B133,B136,B137,B15,B16,B2,B22,B26,B31,B34,B37,B53,B56,B67,B75,B78,B80,B82,B87,B99,C11,C19,C2,C23,C24,C29,C30,C33,C41,C42,C43,C47,C49,C52,C59,C63,C69,C7,C71,C72,C75,C76,C78,C86,C9,D1,D10,D3,D5
`Chr5:50106781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr5:50106815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C56
`Chr5:50106858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr5:50106873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B127,B29,B98,C80
`Chr5:50106894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B33,B72,D5
`Chr5:50106956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C80
`Chr5:50106964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C80
`Chr5:50107008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C80
`Chr5:50107051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910855.1
GAGTTTCTTGAGTTGGAAACAATCGCAAGGCGTAATACATGAATTTTGAAATTATTGCACAAAAACGAAAGCTTTTCAGATTTTTTTGGTGGGATGGGATTATTTTCTTCGTTTCTTTTGACTTGTCGGAATGTATTCGGTGGTCAATAGCCAAAACAAAAAAGTGGTCATACAAGATTTTGAAGGGCTGGAGCCCACTAAAAATCGAAAGCTGGGACCCACGTTTTGACAGTCCAATTCCACTAACGCCAAATTCATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987207
ATGGCTGATTTCTTCGCAGATAGCGACGATGACAAGGCGGTCGAGGAGCTCTTATCTCAGGCCATGGACGCCACCGTTCTGGAGCAGGTCGCCGCCGTCAACTGCGCCGGTTTCAACGACGACGGCCTCCCTTCTCATCTCCAAACCCGCTTTCAGAAGCTTAAATCGTTCCCGTCATCGGCGGCGAACCCCACTCCTCTCTCGACAAAAAGCTTCAATCTTTCACACACTCCGGATTTCAAGAAAAACGGCGCCGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766838.1
MADFFADSDDDKAVEELLSQAMDATVLEQVAAVNCAGFNDDGLPSHLQTRFQKLKSFPSSAANPTPLSTKSFNLSHTPDFKKNGAVNEAKAPLSSEEKTAEKKSTKCSTKSPDENSCLSDAETPSQSPFKEIPQRKLKKNAKKSAKSLSFSSCDGFSSRSVSPPAKSGCFLCSPKKVSKKKSKENRGLDFGVDCGKSDELLSDLSNFSVRSQRRMIKKAMEEEERISREAEKIVKWAKQASARMEISGIEDEISDDDNAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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