当前解析结果
SmilChr05G003708| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003708 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003708 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003708 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 50160806 - 50163700 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987217 |
|---|---|
| GeneID | 130987217 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987217 |
| 原始查询 | SmilChr05G003708 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987217 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057766855.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.80000 | XP_057766861.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057766855.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766855.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766855.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:50161220 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C21,C31 |
Chr5:50161226 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C21,C31 |
Chr5:50161246 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B80,B96,C21,C31 |
Chr5:50161246 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | B80,B96,C21,C31 |
Chr5:50161268 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B80,C85 |
Chr5:50161273 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B80,C85 |
Chr5:50161280 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr5:50161295 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B80,B90,C4,C85 |
Chr5:50161891 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr5:50162139 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr5:50162155 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B107,B13,C52,C79 |
Chr5:50162160 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 155 | A1,A10,A11,A14,A16,A18,A2,A21,A22,A23,A3,A6,A8,A9,B10,B100,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B111,B114,B119,B12,B122,B123,B125,B127,B128,B129,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B44,B46,B47,B48,B51,B54,B55,B6,B60,B63,B66,B68,B71,B72,B73,B78,B8,B81,B82,B83,B85,B87,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B99,C10,C13,C14,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C26,C27,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C37,C4,C40,C42,C45,C46,C47,C5,C52,C53,C54,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C68,C7,C72,C73,C77,C78,C79,C8,C81,C84,C85,C86,C9,D11,D2,D3,D4,D5,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
22 records
下载 cDNA FASTA8 records
下载 CDS FASTA8 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。