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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003711`

染色体: Chr05 坐标: 50197485-50199493 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003711`
名称	SmilChr05G003711
描述	uncharacterized SmilChr05G003711
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50197485 - 50199493 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026085`
GeneID	`131026085`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026085`
原始查询	`SmilChr05G003711`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0610200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0610200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0610200` - identity=24.1; qcov=0.406; evalue=1.02e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026085

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811843.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811843.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811843.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811843.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811843.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50197656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr5:50197684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr5:50197704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr5:50197716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B85,B92,C31
`Chr5:50197734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr5:50197767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A19,A25,A3,A8,B100,B106,B112,B124,B125,B127,B13,B135,B139,B24,B28,B29,B32,B33,B37,B41,B42,B57,B6,B69,B77,B79,C14,C21,C24,C43,C47,C50,C51,C60,C72,C75,C77,C81,C86,D2
`Chr5:50197780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C59
`Chr5:50197787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,D4
`Chr5:50197792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C57
`Chr5:50197794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B128,B19,C38
`Chr5:50197822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:50197839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B101,B41,B82,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811843.1

429 aa

214

429

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 229-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811843.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	229	356	3.6e-09	37.6	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955860.1
ATGTCTGCCCACACAACTGTAGACATTGACCAGTCACTTCTTCTTCATCCCCTCGGTGGAATCGTCGACATTGAAGATGACGATGAACCAGAAGACGATGATCAACCGTTGACATCTGATGACGACGATAGTGATGATGACAGTAGTGATGGTTACATGTCTCATCGTAGAAGTTTATTTTCGTTTGGTCGATCTGGTCGGTCTGATCGGGATGAGCAGCCGACTGATGACATATCTGATGGGTCCGGTACAGGGATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026085
ATGTCTGCCCACACAACTGTAGACATTGACCAGTCACTTCTTCTTCATCCCCTCGGTGGAATCGTCGACATTGAAGATGACGATGAACCAGAAGACGATGATCAACCGTTGACATCTGATGACGACGATAGTGATGATGACAGTAGTGATGGTTACATGTCTCATCGTAGAAGTTTATTTTCGTTTGGTCGATCTGGTCGGTCTGATCGGGATGAGCAGCCGACTGATGACATATCTGATGGGTCCGGTACAGGGATTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811843.1
MSAHTTVDIDQSLLLHPLGGIVDIEDDDEPEDDDQPLTSDDDDSDDDSSDGYMSHRRSLFSFGRSGRSDRDEQPTDDISDGSGTGISATPETPQASSSSRARRPRGPTVAHIWANSTREAHGRIVFQRMPNGTLMEPVGLAKACTKAFKMVDNPGGYTWRLTPPAVKDSYFDELHKEFAWSPEDELLVRAMWKQKANKRYSDMMSDYKRKLRASTDEGRGMDRPLWMSAEFWTGLQAYWSQEAVQAVSQRARANRMSEPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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