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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003715`

染色体: Chr05 坐标: 50277539-50280247 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003715`
名称	SmilChr05G003715
描述	uncharacterized SmilChr05G003715
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50277539 - 50280247 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026086`
GeneID	`131026086`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026086`
原始查询	`SmilChr05G003715`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=41.9; qcov=0.226; evalue=2.12e-31; confidence=weak
Rice	`Os12g0142900` - identity=46.5; qcov=0.531; evalue=1.36e-111; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF00098 (zf-CCHC); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026086

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811844.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057811844.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811844.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057811844.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057811844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50277674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	45	A13,A18,B105,B114,B120,B128,B130,B131,B135,B136,B22,B25,B34,B36,B38,B39,B46,B49,B53,B60,B62,B66,B74,B77,B82,B83,B84,B85,B91,C10,C15,C19,C30,C33,C37,C42,C44,C52,C64,C66,C70,C74,C84,D11,D2
`Chr5:50277689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B37
`Chr5:50277837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr5:50277862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B72,C41,D5
`Chr5:50277898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr5:50278069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B64
`Chr5:50278106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C29,C44
`Chr5:50278111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B38,B41,B5,C81
`Chr5:50278142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B41,B58,B64,C23,C32
`Chr5:50278142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B58,B64,C23,C32
`Chr5:50278153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B3,B47,C19
`Chr5:50278157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B3,B47,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811844.1

655 aa

328

655

zf-CCHC

RVT_1

RT_RNaseH_2

PF00098 zf-CCHC 98-113 aa PF00078 RVT_1 311-470 aa PF17919 RT_RNaseH_2 534-587 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811844.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	98	113	4.7e-07	30.3	Zinc knuckle
`XP_057811844.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	311	470	1.3e-39	136.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057811844.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	534	587	2.1e-17	63.7	RNase H-like domain found in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955861.1
ATGGCCGAGAAGTTTCGTTCAGGCCTTAGGCATGAGATCAAGATGGCGCTTGCTGGTCATGGTAATCTCACCCACTCTGAGGCACTTAGCAGAGCCTTGGATGTTGAAGCAGCCATGCCTGAAGACCGCCCAACCCAGACTCAAGCTTCAGGAAACAACGATCGTGGGAAGAGAAAATGGGATGGACGACCAGTCAATCCAGGATCAGCTGGAAACAATCAAGGCCAGCTCAGGGCACCTTTGTGTCCCAAATGCTCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026086
ATGGCCGAGAAGTTTCGTTCAGGCCTTAGGCATGAGATCAAGATGGCGCTTGCTGGTCATGGTAATCTCACCCACTCTGAGGCACTTAGCAGAGCCTTGGATGTTGAAGCAGCCATGCCTGAAGACCGCCCAACCCAGACTCAAGCTTCAGGAAACAACGATCGTGGGAAGAGAAAATGGGATGGACGACCAGTCAATCCAGGATCAGCTGGAAACAATCAAGGCCAGCTCAGGGCACCTTTGTGTCCCAAATGCTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811844.1
MAEKFRSGLRHEIKMALAGHGNLTHSEALSRALDVEAAMPEDRPTQTQASGNNDRGKRKWDGRPVNPGSAGNNQGQLRAPLCPKCSKSHHGICLAGSNTCFKCGQKGHFARDCQGKPQGGMRGPNQPSQVQPLRAIQGQQLLYPPPQQQHRPAIRPPQIPQARAYALHKNKQGNNQGNLAGRDALSFHGICRRNRVPTISALQARKMMNKKDCQAFLVYLNGGIETKKTMEDVEIVRDFQDVFPENLPGLPPDRQVEFTI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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