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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003727`

染色体: Chr05 坐标: 50372305-50375796 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003727`
名称	SmilChr05G003727
描述	bZIP transcription factor RISBZ4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50372305 - 50375796 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987197`
GeneID	`130987197`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987197`
原始查询	`SmilChr05G003727`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bZIP transcription factor RISBZ4-like
产物	bZIP transcription factor RISBZ4-like
Arabidopsis	`AT5G24800` (BZIP9) basic leucine zipper 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832549] identity=51.3; qcov=0.966; evalue=2.5e-59; confidence=high
Rice	`Os02g0175100` (OsbZIP15) - identity=65.3; qcov=0.647; evalue=8.72e-63; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00170 (bZIP_1); PF07716 (bZIP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987197

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766828.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766828.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766828.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766828.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766828.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50372585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr5:50372604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:50374893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr5:50375611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B68
`Chr5:50375630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:50375646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B21,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766828.1

299 aa

150

299

bZIP_1

bZIP_2

PF00170 bZIP_1 148-198 aa PF07716 bZIP_2 149-198 aa

XP_057766829.1

232 aa

116

232

bZIP_1

bZIP_2

PF00170 bZIP_1 81-131 aa PF07716 bZIP_2 82-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766828.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	148	198	2e-14	54.1	bZIP transcription factor
`XP_057766828.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	149	198	1e-09	39.0	Basic region leucine zipper
`XP_057766829.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	81	131	1.4e-14	54.6	bZIP transcription factor
`XP_057766829.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	82	131	7.1e-10	39.5	Basic region leucine zipper

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910845.1
CACCTTTTCTCTTTCAATAACAAAAGCCACTTTGGCTTCTTCCTCATTTCACTTCCACCTACCTTTCTTCTTTTCTTATATACTTCACATCCCTCTCTTCATTTCTCCCCTTTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTCACACACACACACACACACACAGACACAATTGTGAGTGAAGACAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACACACAAAAGGTGAACCAGTTACTGCAATCTACAATGGATAACAAGAA...

XM_057910846.1
ACTTCCACCTACCTTTCTTCTTTTCTTATATACTTCACATCCCTCTCTTCATTTCTCCCCTTTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTCACACACACACACACACACACAGACACAATTGTGAGTGAAGACAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACACACAAAAGGTGAACCAGTTACTGCAATCTACAATGGATAACAAGAAAACGATTTTGAAGAACAGTTCAATCTATGGCTGCAGCGACATGAAGAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987197
ATGGATAACAAGAAAACGATTTTGAAGAACAGTTCAATCTATGGCTGCAGCGACATGAAGAAAAGCCAATCTGAATTAGCTCTTCAGGAACTTTTTGCCTCTGAAGACGACAGAAAATTTCATCACTTTGAAGGCTCTGATTCCTATCATGCTCTCTTTGCCATGGACCACGCTGATCATGTCACTTTTCCTTTCAAGAATTTGGAAATCCGTAGAGAAATATCAGCTTCTAATGCATTGGCAGAGCCTCCGGTTTGGCC...

LOC130987197
ATGGAAATCCGTAGAGAAATATCAGCTTCTAATGCATTGGCAGAGCCTCCGGTTTGGCCTTGGAAGCCGATTGAATCCCAGTCATCCATATGTGTTGATAGCCCCACGTCCGTGTATACCTCAAAGGGCGCGGATAACCAAGCAGTTGGCGCTAGCAGTGGCTCGTCACACGACCAATCAGACGAAGAGGACATGGAGATAGAAGCAGGCTCTTATGATCCCACCACCAATCCTATTGATGTCAAGCGCATCAAAAGGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766828.1
MDNKKTILKNSSIYGCSDMKKSQSELALQELFASEDDRKFHHFEGSDSYHALFAMDHADHVTFPFKNLEIRREISASNALAEPPVWPWKPIESQSSICVDSPTSVYTSKGADNQAVGASSGSSHDQSDEEDMEIEAGSYDPTTNPIDVKRIKRMVSNRESARRSRRRKQAHLADLEQQVEQLRGENATLFKQLADATQQFKDSTTNNRVLRSDVEALRAKVKLAEDMVARGSLTSSLSHLLQNYLTTPQDYISSSGIPPV...

XP_057766829.1
MEIRREISASNALAEPPVWPWKPIESQSSICVDSPTSVYTSKGADNQAVGASSGSSHDQSDEEDMEIEAGSYDPTTNPIDVKRIKRMVSNRESARRSRRRKQAHLADLEQQVEQLRGENATLFKQLADATQQFKDSTTNNRVLRSDVEALRAKVKLAEDMVARGSLTSSLSHLLQNYLTTPQDYISSSGIPPVMGARADTYSGSAAVGLHGVVGDAVPDIWTWEVDPIPSSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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