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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003742`

染色体: Chr05 坐标: 50529204-50531256 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003742`
名称	SmilChr05G003742
描述	uncharacterized SmilChr05G003742
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50529204 - 50531256 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987192`
GeneID	`130987192`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987192`
原始查询	`SmilChr05G003742`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0284900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0284900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G39380` (AT5G39380) Plant calmodulin-binding protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833934] identity=72.2; qcov=0.093; evalue=2.54e-07; confidence=weak
Rice	`Os04g0284900` - identity=29.8; qcov=0.512; evalue=2.6e-09; confidence=low
GO	GO:0005516 (calmodulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF07839 (CaM_binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987192

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057766822.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057766822.1`
3	Spindle	Spindle	0.20000	`XP_057766822.1`
4	Spindle pole	Spindle pole	0.20000	`XP_057766822.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766822.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50530187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:50530542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:50530558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:50530806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B136,B66,C33
`Chr5:50530826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,C7,D6
`Chr5:50530962`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B115,B15,B16,B87,B88,B93,C34,C49,C56,C7,D6
`Chr5:50531021`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B115,B15,B87,B88,B93,C34,C49,C55,C56,C7,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766822.1

387 aa

194

387

CaM_binding

PF07839 CaM_binding 278-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766822.1`	Pfam	`PF07839`	CaM_binding	Domain	278	382	9.4e-13	49.6	Plant calmodulin-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910839.1
TCAAGGTTTGATTTCAAAGTAACCAATCCTTCTCACAAATACCTCTCTCATCTCCCCCTTTCAAATACTGTCAACTTTCTTTCATTACATCAAGAATTCTTTGCCATCTTCTTCTTATTCTTTTTCTTCTCAATTATTTTGTTGGGAAGAAAAAGACTTCATTTTTGCATCATCTAAGGCATCAAGAAGTGCCAATCATTGCATGGCAACAAGAAGAAGAGAAGCTTTTCCTGGCAAGGAGAAGGCAACACCTTCTCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987192
ATGGCAACAAGAAGAAGAGAAGCTTTTCCTGGCAAGGAGAAGGCAACACCTTCTCCACAAACAGGAACAGCAAAGCTTAGAGGAGCTGTAAATCAAATTTCCAAACCAAAAGTTTCAACTGCACCACAAAAACAGACTAGGCCAGCAGTGTCGAGAACCACCCCGGTTGCCGATGTTTCTAAGCCTCAGACCAGGAAACCAGCCTCCCCAGCCACTGCAACCAAGCCTGCACAAACCAGAACAAGATCCTTGGACAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766822.1
MATRRREAFPGKEKATPSPQTGTAKLRGAVNQISKPKVSTAPQKQTRPAVSRTTPVADVSKPQTRKPASPATATKPAQTRTRSLDNKTATPTQKTRVLAAAAATPAAATRRASSLPVKAAVAAPKPAPAKKWKPVEKEEGKRRLSSTSVGSGRRSSIGLKKESGRSAPAAKEQQHVTGFNLDKNENLSMYCVTEPEMQLQDIEYSYLAEAEEKTVQSLSDFEKGIDDLVREDQEPLSFAKIEDPAVVIAGSSAVSGQQES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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