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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003747`

染色体: Chr05 坐标: 50606674-50610378 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003747`
名称	SmilChr05G003747
描述	serine/arginine-rich splicing factor RSZ22-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50606674 - 50610378 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987214`
GeneID	`130987214`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987214`
原始查询	`SmilChr05G003747`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/arginine-rich splicing factor RSZ22-like
产物	serine/arginine-rich splicing factor RSZ22-like
Arabidopsis	`AT4G31580` (RSZ22) serine/arginine-rich 22 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829285] identity=65; qcov=1.12; evalue=6.52e-64; confidence=high
Rice	`Os02g0610600` (RSZ23) - identity=62.3; qcov=1.15; evalue=1.67e-62; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016607 (nuclear speck)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987214

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766844.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057766844.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057766844.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766844.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50607193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:50607567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B46
`Chr5:50608224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:50608243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766844.1

181 aa

181

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 4-61 aa PF00098 zf-CCHC 92-107 aa

XP_057766846.1

181 aa

181

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 4-61 aa PF00098 zf-CCHC 92-107 aa

XP_057766847.1

178 aa

178

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 4-61 aa PF00098 zf-CCHC 92-107 aa

XP_057766848.1

178 aa

178

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 4-61 aa PF00098 zf-CCHC 92-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766844.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	4	61	8.1e-17	61.6	RNA recognition motif
`XP_057766844.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	92	107	9.2e-08	32.6	Zinc knuckle
`XP_057766846.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	4	61	8.1e-17	61.6	RNA recognition motif
`XP_057766846.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	92	107	9.2e-08	32.6	Zinc knuckle
`XP_057766847.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	4	61	7.8e-17	61.6	RNA recognition motif
`XP_057766847.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	92	107	9e-08	32.6	Zinc knuckle
`XP_057766848.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	4	61	7.8e-17	61.6	RNA recognition motif
`XP_057766848.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	92	107	9e-08	32.6	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

8 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089599.1
TTAATTTCTTAAATCAGCCTTCGCCAGCCGCTAGGGTTTATCCAGAACTCAACTAGGGTTTCAGGATTTTCTTCCCAATAATTCTGGTTCAAGATGTCAAGGGTTTACGTTGGGAATTTGGATCCCCGAGTCACTGAACGAGAACTCGAAGATGAATTTCGCGTTTTTGGGGTTATTAGAAGTGTGTGGGTTGCCAGAAGACCCCCTGGTTATGCTTTCATTGATTTTGATGATCGCAGGGATGCTCAAGATGCCATCAG...

XR_009089600.1
CTTAAATCAGCCTTCGCCAGCCGCTAGGGTTTATCCAGAACTCAACTAGGGTTTCAGGATCCCTCCTCCCTCTGTGTTTTTAGGATTTTCTTCCCAATAATTCTGGTTCAAGATGTCAAGGGTTTACGTTGGGAATTTGGATCCCCGAGTCACTGAACGAGAACTCGAAGATGAATTTCGCGTTTTTGGGGTTATTAGAAGTGTGTGGGTTGCCAGAAGACCCCCTGGTTATGCTTTCATTGATTTTGATGATCGCAGGG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130987214
ATGTCAAGGGTTTACGTTGGGAATTTGGATCCCCGAGTCACTGAACGAGAACTCGAAGATGAATTTCGCGTTTTTGGGGTTATTAGAAGTGTGTGGGTTGCCAGAAGACCCCCTGGTTATGCTTTCATTGATTTTGATGATCGCAGGGATGCTCAAGATGCCATCAGGGACCTTGATGGTAAAAATGGCTGGAGAGTTGAGCTATCCCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGGAGGCGGCCGTGGTGGGGGTCGTGGACGCTC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057766844.1
MSRVYVGNLDPRVTERELEDEFRVFGVIRSVWVARRPPGYAFIDFDDRRDAQDAIRDLDGKNGWRVELSHNSRGGGGGGRGGGRGRSGSDLKCYECGEPGHFARECRMRGGSGRRRSRSPAARYRRSPSYGRRSFSPRARSPRRRSLSPRPRSYSRSPYRGREEVPYANGNGIRERRRSRS

XP_057766846.1
MSRVYVGNLDPRVTERELEDEFRVFGVIRSVWVARRPPGYAFIDFDDRRDAQDAIRDLDGKNGWRVELSHNSRGGGGGGRGGGRGRSGSDLKCYECGEPGHFARECRMRGGSGRRRSRSPAARYRRSPSYGRRSFSPRARSPRRRSLSPRPRSYSRSPYRGREEVPYANGNGIRERRRSRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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