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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003750`

染色体: Chr05 坐标: 50628230-50633251 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003750`
名称	SmilChr05G003750
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 18
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50628230 - 50633251 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987179`
GeneID	`130987179`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987179`
原始查询	`SmilChr05G003750`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 18
产物	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 18
Arabidopsis	`AT4G31670` (UBP18) ubiquitin-specific protease 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829295] identity=56.6; qcov=0.913; evalue=3.4e-176; confidence=high
Rice	`Os06g0654000` - identity=58; qcov=0.829; evalue=1.52e-156; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00443 (UCH); PF13423 (UCH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987179

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766809.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057766809.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057766809.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766809.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50628260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B52
`Chr5:50628260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr5:50628277`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A10,A14,B111,B123,B133,B28,B74,B77,B81,C17,C27,C53,C82,C86,C9
`Chr5:50628302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:50628309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:50628316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C4
`Chr5:50628788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B38,B39
`Chr5:50629367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:50629446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr5:50630321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:50630337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr5:50630376`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766809.1

503 aa

252

503

UCH

UCH_1

PF00443 UCH 163-464 aa PF13423 UCH_1 164-443 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766809.1`	Pfam	`PF00443`	UCH	Family	163	464	2.8e-55	188.4	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase
`XP_057766809.1`	Pfam	`PF13423`	UCH_1	Domain	164	443	8.2e-18	65.8	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910826.1
ACATAAGGAAAACTTTATAGAAACCCAAACGCGAACGAAATACAAACCCAGAATTCCACCTTTTTTGATTCACAATTGATAAGATTGTTCAAATCCAGAGCTGTAAACTTAGTTGTGTGCATTATTGATCGAAAAAAAAGTTTCATATATCAAATCAATAGTAGGACGAAATCATAAGCTGTAGATGCATGCGGCTGTAGACTTCGATTGGTTGCTGCAATTCACGGTGTCTGCTGCGGCGGAGACAGCGGCGGCGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987179
ATGCATGCGGCTGTAGACTTCGATTGGTTGCTGCAATTCACGGTGTCTGCTGCGGCGGAGACAGCGGCGGCGATGGTGGCAAGGTTTCTCAATTTCGTTCGGAGCACTTCGTCTTTAGTTTTGGCAGTTGCCTCCAATATCGGTTCTTCGCCGGATCGCAGTAACGAAGGGATGATGGAGGCGGCAGTCGGCGGAGCCGCCAAGGTTGTTGACTGCTGCGCTTTTTGCGGCATTACCATGGGGAGACGCTTCGCCGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766809.1
MHAAVDFDWLLQFTVSAAAETAAAMVARFLNFVRSTSSLVLAVASNIGSSPDRSNEGMMEAAVGGAAKVVDCCAFCGITMGRRFAGDEMVEYCSASCQSSHWNVERETKCTRTKSPYALTGRKVSLLSSVESSEINEQSNEILFPYEEFIEFFNWEKPGYPPCGLINGGNSCFANVVLQCLTYTRPLAAYILEKGHKLECRMDKWCFLCDFQTHVERASWSHTAFIPINILSRLNFIGGNLECGQQEDAHEFLRFAIDKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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