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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003783`

染色体: Chr05 坐标: 51152564-51159309 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003783`
名称	SmilChr05G003783
描述	uncharacterized SmilChr05G003783
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	51152564 - 51159309 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024844`
GeneID	`131024844`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024844`
原始查询	`SmilChr05G003783`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OSJNBa0040K22.112-1; symbol=OSJNBa0040K22.112-1; hit=Os07g0459200; species=rice; confidence=high
产物	OSJNBa0040K22.112-1; symbol=OSJNBa0040K22.112-1; hit=Os07g0459200; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G24970` (AT5G24970) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832567] identity=68.7; qcov=0.931; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0459200` (OSJNBa0040K22.112-1) - identity=69.6; qcov=0.906; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03109 (ABC1); PF27536 (UbiB_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024844

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810361.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057810361.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810361.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810361.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810361.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:51152619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B71
`Chr5:51152797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3
`Chr5:51152799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B72,C14
`Chr5:51153268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:51153602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B64,B65
`Chr5:51153682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:51153975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:51154196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C22
`Chr5:51155479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr5:51155894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A3,B27,B52
`Chr5:51156220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B70,B82,C78
`Chr5:51157325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810361.1

723 aa

362

723

ABC1

UbiB_helical

PF03109 ABC1 175-433 aa PF27536 UbiB_helical 471-512 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810361.1`	Pfam	`PF03109`	ABC1	Domain	175	433	1.9e-72	244.1	ABC1 atypical kinase-like domain
`XP_057810361.1`	Pfam	`PF27536`	UbiB_helical	Domain	471	512	7e-07	29.5	UbiB helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954378.1
TGAAGCTACTGCTACGCGGCCTACGCCAAAGGCCAAGGGCGCCGCTTTACCGCTTTAGCAAAGACACGTCTGCTTAAAAACGAAAACGTATATATAGATCTTCAGCTACGCATTTCAACAAACAGTTTGCATCCATCATCGAATGGGGTTTTCTTATCACCAATTCGTTACAACCCTGAAGAATTAATTGCCTCCGATTTCCATCTCCATGACGAGCCTGGTTACCTGCTTGAAGCGACGCCGTCTTTCTCTTCATTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024844
ATGACGAGCCTGGTTACCTGCTTGAAGCGACGCCGTCTTTCTCTTCATTTCCCGCTTTTGGGGAATGGAAACCCTGATGAGGCGATCAGGTTGAGGCTGATGCTGCTCGGAGGGCCCAACTATCTTGTAAATAGAATGCATGGTGCTGATAGCTCGTTGAGATTGTTTCAGCCCAAATTTTTCTCTACTCACCATTCCAGTGTGCATGGTGAAAGTCCTTCTGCTGAGTATGCAAAGTTGAGGAAAGAGTCACTAGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810361.1
MTSLVTCLKRRRLSLHFPLLGNGNPDEAIRLRLMLLGGPNYLVNRMHGADSSLRLFQPKFFSTHHSSVHGESPSAEYAKLRKESLEGQFGRMLGSKSVSVFYRFGPFLAVYRAATISFYVLKLAIWRFFVRDMNKRSVKFREMLIRLGPFYIKLGQALSTRPDILPKVYCQELAKLQDQIPPFPTDVAIKSIESQLGMPVSKLFADISKEPVAAASLGQVYKAHLHSGELVAVKVQRPGMSHLLTLDALLFNMIGGQLKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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