当前解析结果
SmilChr05G003785| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003785 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003785 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003785 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 51170826 - 51173667 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024847 |
|---|---|
| GeneID | 131024847 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024847 |
| 原始查询 | SmilChr05G003785 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024847 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057810363.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057810363.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057810363.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810363.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810363.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:51172214 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A11,B76 |
Chr5:51172258 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B27,B52 |
Chr5:51172261 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B5,C52,C59,C71 |
Chr5:51172286 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A2,A20,A3,B10,B126,B49,B51,B58,B81,B87,C44,C76,D9 |
Chr5:51172290 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 23 | A11,A20,B112,B119,B126,B13,B140,B22,B33,B50,B76,B80,B98,C1,C25,C31,C35,C39,C44,C46,C48,C83,D2 |
Chr5:51172313 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B99,C87 |
Chr5:51172318 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B67 |
Chr5:51172347 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C16,C42 |
Chr5:51172357 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B67 |
Chr5:51172369 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,C25 |
Chr5:51172426 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B67 |
Chr5:51172479 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B6,B82,C26 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。