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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003793`

染色体: Chr05 坐标: 51266820-51270674 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003793`
名称	SmilChr05G003793
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 18
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	51266820 - 51270674 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024857`
GeneID	`131024857`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024857`
原始查询	`SmilChr05G003793`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 18
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 18
Arabidopsis	`AT2G24830` (AT2G24830) zinc finger (CCCH-type) family protein / D111/G-patch domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817020] identity=56; qcov=1.02; evalue=2.2e-175; confidence=high
Rice	`Os02g0793000` (OsC3H18) - identity=61.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF01585 (G-patch); PF18044 (zf-CCCH_4); PF26738 (SH3_AtC3H22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024857

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810386.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810386.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810386.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810386.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810386.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:51267112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:51267158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,C2,C62
`Chr5:51267187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C86
`Chr5:51267199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C86
`Chr5:51267244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B54,B60,B99,C87
`Chr5:51267318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C30
`Chr5:51267371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:51267474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B101,B104,B17,C23,C31
`Chr5:51267474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B104,B17,C23,C31
`Chr5:51267484`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B53,C22,C78
`Chr5:51267484`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B53,C22,C78
`Chr5:51267503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810386.1

497 aa

248

497

zf-CCCH_4

SH3_AtC3H22

G-patch

PF18044 zf-CCCH_4 147-166 aa PF26738 SH3_AtC3H22 182-241 aa PF01585 G-patch 296-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810386.1`	Pfam	`PF18044`	zf-CCCH_4	Domain	147	166	2.7e-08	34.1	CCCH-type zinc finger
`XP_057810386.1`	Pfam	`PF26738`	SH3_AtC3H22	Domain	182	241	1.5e-32	111.7	AtC3H22-like, SH3 domain
`XP_057810386.1`	Pfam	`PF01585`	G-patch	Family	296	338	2.3e-14	53.7	G-patch domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954403.1
AAATAAAATCGGTACAGTCCTTGAATATAACTAGCAACTACCAAAAAGCGTTAATTTCGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTGGGAACTTGGGAGTTCCAATGGCGGATGACGAGGAAGCGAGGGTTGTGGAAGAGCAGCTCCAATTCCAACTCAAGGAACAGAAGGACTCTCTCGCCGCCGTCGCCGACGCCCTCTCCGTCGATCCCTCCAACGCCGAACTTATTTCGGTTCATGATGAGCTTGTTGAGGCCATTAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024857
ATGGCGGATGACGAGGAAGCGAGGGTTGTGGAAGAGCAGCTCCAATTCCAACTCAAGGAACAGAAGGACTCTCTCGCCGCCGTCGCCGACGCCCTCTCCGTCGATCCCTCCAACGCCGAACTTATTTCGGTTCATGATGAGCTTGTTGAGGCCATTAAAGATGCTGAGGAGGGCCTTTTTCAGCTCAAAAGAGCAAGGTTGATAAGAGAGGCTGATTCTGCTTTGAAAGGTTTAGTAAGCACTGGCGATGTCAAAGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810386.1
MADDEEARVVEEQLQFQLKEQKDSLAAVADALSVDPSNAELISVHDELVEAIKDAEEGLFQLKRARLIREADSALKGLVSTGDVKVEPLEPTDVEPEPLVDQTYSIGSKCRFRHTDGRWYNGLIVGLEGSESAKISFLTPTTESMLMCKFFLQQRCRFGSNCRLSHGIDVPVSSLKKYIPTIWEQSLVGSSIWALSDSKAGIWREAELESWDENLRTGEVIFRDDGSSAKLGTEAITSSEYAQRSDEEESDLSSEQSDSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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