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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003797`

染色体: Chr05 坐标: 51295620-51298508 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003797`
名称	SmilChr05G003797
描述	ubiquitin C-terminal hydrolase 22-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	51295620 - 51298508 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024861`
GeneID	`131024861`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024861`
原始查询	`SmilChr05G003797`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin C-terminal hydrolase 22-like
产物	ubiquitin C-terminal hydrolase 22-like
Arabidopsis	`AT5G10790` (UBP22) ubiquitin-specific protease 22 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830946] identity=55; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0647300` - identity=62.3; qcov=0.68; evalue=2.39e-163; confidence=high
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00443 (UCH); PF02148 (zf-UBP); PF13423 (UCH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024861

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810391.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810391.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810391.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810391.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810391.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:51296404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B7,D10,D4
`Chr5:51296546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:51297131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,D9
`Chr5:51297164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B27,B58,C2
`Chr5:51297666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B21,B62,C1,C43
`Chr5:51298161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr5:51298236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B28,B65,B90,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810391.1

557 aa

278

557

zf-UBP

UCH

UCH_1

PF02148 zf-UBP 53-116 aa PF00443 UCH 183-525 aa PF13423 UCH_1 184-504 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810391.1`	Pfam	`PF02148`	zf-UBP	Domain	53	116	5.3e-07	30.5	Zn-finger in ubiquitin-hydrolases and other protein
`XP_057810391.1`	Pfam	`PF00443`	UCH	Family	183	525	9.2e-62	209.6	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase
`XP_057810391.1`	Pfam	`PF13423`	UCH_1	Domain	184	504	1.3e-19	71.7	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954408.1
TTAACACTCCTCACTCCCACTCTATGATTTTGGTCTGTGGTCCACATCGTCAATTGCTGGCTTATCATCTCAATTCTCATGATCAAATTTTAAACGGCTGTGATCTTTCGATCAAAATGGTCTGTCCCACAGCAGAAAAAATGAGTCGGTGACTCTCTGCAAACAGGAAAGCGCCTCCATCTCTCCTCCTCCATCTCCGTTCCTCTCTGCCACTGAGGATTCAGCTTTTGATAAATTATTAAAAAAAAAAAAAACTTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024861
ATGTCATCAAGAAACTCTTCCTTCACAATCCCTAGGCCTTGCAAGCATCTTGTGGATTACAAGATGAAGCACGGATTAAAGGGTTACAATTCGATCCAAGATTTGTTGAAGTTCAGCCCATATGGTAGAATAATGATTGATAAATCAGATCCCAGATGCAGTTTCTGCTCTGGTTGCTGTGGCAGATTGTTTATGTGTTTGATCTGCTCCTCAGTTACATGCTGCATAAATCAAGAATCAAATCATGCCCTTTTGCATTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810391.1
MSSRNSSFTIPRPCKHLVDYKMKHGLKGYNSIQDLLKFSPYGRIMIDKSDPRCSFCSGCCGRLFMCLICSSVTCCINQESNHALLHCESVCGHEIGVDMERAELYCSVCCDQVYDIEFDRVVMCKKMLGLSRNGSDGVVESGQLRLSKRRRLDFGADLGSESVKRSVLRSKQRSKSCLPLGLRGLNNLGNTCFMNSVLQALLHAPPFRNYFLSDRHSHERCRKTSADRLCLPCDVDVIFDAVFSGDRTPYSPAKFLYSWW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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