当前解析结果
SmilChr05G003798| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003798 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003798 |
| 描述 | mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 51298542 - 51301143 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131024862 |
|---|---|
| GeneID | 131024862 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024862 |
| 原始查询 | SmilChr05G003798 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30-like |
| 产物 | mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30-like |
| Arabidopsis | AT5G63480 (AT5G63480)mediator of RNA polymerase II transcription subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836467] identity=42.5; qcov=1.06; evalue=2.2e-38; confidence=medium |
| Rice | Os04g0388601 (OsMed30_1)- identity=61.4; qcov=0.249; evalue=8.58e-13; confidence=weak |
| GO | GO:0016592 (mediator complex) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024862 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057810392.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057810392.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810392.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810392.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057810392.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:51300721 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B91,C75 |
Chr5:51300895 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。