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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003800`

染色体: Chr05 坐标: 51316457-51319193 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003800`
名称	SmilChr05G003800
描述	probable phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	51316457 - 51319193 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024864`
GeneID	`131024864`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024864`
原始查询	`SmilChr05G003800`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase
产物	probable phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase
Arabidopsis	`AT2G25080` (GPX1) glutathione peroxidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817046] identity=77.1; qcov=0.743; evalue=5.82e-116; confidence=high
Rice	`Os06g0185900` (OsGpx4) - identity=86.4; qcov=0.611; evalue=2.09e-112; confidence=high
GO	GO:0004602 (glutathione peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00255 (GSHPx); PF00578 (AhpC-TSA); PF08534 (Redoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024864

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810397.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057810397.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810397.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810397.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810397.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:51317826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr5:51319049`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A13,B114,B119,B25,B62,C20,C64
`Chr5:51319061`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B17,B40,C5,D5,D8
`Chr5:51319061`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B17,B40,C5,D5,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810397.1

288 aa

144

288

Redoxin

AhpC-TSA

GSHPx

PF08534 Redoxin 127-201 aa PF00578 AhpC-TSA 128-193 aa PF00255 GSHPx 131-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810397.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	127	201	1.2e-08	35.6	Redoxin
`XP_057810397.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	128	193	9.7e-08	32.7	AhpC/TSA family
`XP_057810397.1`	Pfam	`PF00255`	GSHPx	Family	131	239	2.4e-43	146.8	Glutathione peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954414.1
GTGCTGATTAATGGAACACGTGGCAGTTGTATTCCCATTCCAAACAAACAAGGAAACACGAGACATCCGATCCACCACGTCCACGAGACCCACATTTCTGTTACCAAACTACTGCGTCCAAAATCCACACACTCAGCGTGTTCCGGCCTCGCCAATGGCTTCCATGTCCTTCTCTTCAGTCTTCTCAGCGCCGCTGCAGAGTTTAGCTCTCAATAAACAGCACCTCCCCTCCAATTCCGTGCTGGCGTTTCTCGAATCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024864
ATGGAACACGTGGCAGTTGTATTCCCATTCCAAACAAACAAGGAAACACGAGACATCCGATCCACCACGTCCACGAGACCCACATTTCTGTTACCAAACTACTGCGTCCAAAATCCACACACTCAGCGTGTTCCGGCCTCGCCAATGGCTTCCATGTCCTTCTCTTCAGTCTTCTCAGCGCCGCTGCAGAGTTTAGCTCTCAATAAACAGCACCTCCCCTCCAATTCCGTGCTGGCGTTTCTCGAATCGTCGAATTGGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810397.1
MEHVAVVFPFQTNKETRDIRSTTSTRPTFLLPNYCVQNPHTQRVPASPMASMSFSSVFSAPLQSLALNKQHLPSNSVLAFLESSNWSSLSSSKSTFLRDGFPVLSPILSGFSFKSRSFASVYARAATGKTIHDFSVKDIDGKDVALSKFKGKVLLIVNVASRCGLTSSNYTELSHIYEKYKTQGLEILAFPCNQFGAQEPGSNEDIKNFACTRFKAEFPIFDKVDVNGPNTAPVYQYLKSSAGGFLGDLVKWNFEKFLVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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