Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003801`

染色体: Chr05 坐标: 51337824-51340107 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003801`
名称	SmilChr05G003801
描述	uncharacterized SmilChr05G003801
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	51337824 - 51340107 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024865`
GeneID	`131024865`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024865`
原始查询	`SmilChr05G003801`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817023]; symbol=AT2G24860; hit=AT2G24860; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817023]; symbol=AT2G24860; hit=AT2G24860; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G24860` (AT2G24860) DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817023] identity=71.82; qcov=0.801; evalue=1.59e-54; confidence=high
Rice	`Os09g0423700` - identity=74.0; qcov=0.728; evalue=1.28e-50; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024865

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810398.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057810398.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:51338127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:51338291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B66
`Chr5:51338364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr5:51338404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B35
`Chr5:51339838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B117,B25,B6,B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954415.1
GGCGGCAGGTAGAGGTGTTTGTCTTCACTTCTTCTTCGTAAAAGCGGGCGGAAGTTTCAGCATAACAGTTTTGCGCCACAATAAATTCTCATTTTAATTACAAAATCCCTGCAAAATTTAGCGCGTAGAAATCCAGCGGCGCCCCTCAAAATATCTTCTTTGTTCCTTATTTCGTTGCATCCGGTTTGAAACTTAGCACCTGTAATTTCTTTTGCGATCGTAGTTTGAGATTAGTTGGGCAGAAGAAATAGGAAAATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080391.1_cds_XP_057810398.1_29653
ATGTCGAGCAGTAGCTGCTCTTGTTATAGACCCATGAATTTATATTCGGTGAAATTTGTTGCGCCGTCGAAAAAAGTGGTATTTGTTATGCCGAGGAGGATTGGTGTGAGAGCTTCAATGGTGGAATCATATGGGAGCTCTAATTTCGTGAACCGCATGGAACGTGCGTGGTTGATTTCTCAGCAACCAACGCCTGTTGCTTGTTCTTCATGCGACTCAAAGGGGCACGTTGAATGCAAATGGTGCAGTGGAACGGGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810398.1
MSSSSCSCYRPMNLYSVKFVAPSKKVVFVMPRRIGVRASMVESYGSSNFVNRMERAWLISQQPTPVACSSCDSKGHVECKWCSGTGFFIIGDNMLCQVPSRNTTCVICTGKGSACCADCKGTGFRAKWLGEPPLTK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器