当前解析结果
SmilChr05G003815| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003815 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003815 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003815 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 51448457 - 51451631 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024880 |
|---|---|
| GeneID | 131024880 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024880 |
| 原始查询 | SmilChr05G003815 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024880 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057810414.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057810414.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810414.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810414.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057810414.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:51449053 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B94,C11,C69 |
Chr5:51449055 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | A1,B117,B139,B21,B4,B41,B58,B74,B85,B91,C65 |
Chr5:51449063 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,C15 |
Chr5:51449070 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B19,C49 |
Chr5:51449071 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr5:51449072 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B129,C7 |
Chr5:51449083 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B113,B122,C15 |
Chr5:51449109 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B113,B122,C15 |
Chr5:51449121 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B113 |
Chr5:51449393 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C33 |
Chr5:51449395 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B19,B22,B67 |
Chr5:51449395 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B19,B22,B67 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
10 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。