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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003820`

染色体: Chr05 坐标: 51504907-51507855 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003820`
名称	SmilChr05G003820
描述	premnaspirodiene oxygenase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	51504907 - 51507855 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024884`
GeneID	`131024884`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024884`
原始查询	`SmilChr05G003820`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	premnaspirodiene oxygenase-like
产物	premnaspirodiene oxygenase-like
Arabidopsis	`AT3G26300` (CYP71B34) cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822234] identity=41; qcov=0.99; evalue=6.04e-132; confidence=medium
Rice	`Os09g0275400` - identity=45; qcov=0.941; evalue=3.52e-141; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00909 (Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024884

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057810420.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057810420.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810420.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810420.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810420.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:51506852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B78,B96,C45,C51,C72
`Chr5:51506970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B32,B40
`Chr5:51507092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr5:51507120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B90,B92
`Chr5:51507219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B55,C74
`Chr5:51507234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C55
`Chr5:51507297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:51507304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B55,B90,B92
`Chr5:51507304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B90,B92
`Chr5:51507314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B140,B55,C30,C55
`Chr5:51507374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,C30,C60
`Chr5:51507386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B140,B55,C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810420.1

508 aa

254

508

p450

PF00067 p450 37-485 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810420.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	37	485	3.6e-99	333.3	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954437.1
TACGGTGCAAAATTACTATTTTTGATTGATTACCGGTGTCACGCGCATCACCCATAACTAACCTTGCACGAGGTTTACATCACCTAAGCTTGCAAACTCAAAATCATTGGAATAAACCCACAATAAATACATCCTCCCAAATCCAAAAACAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAATGCTAGTTCTATGCAACTTATCTACTGCTGCTCTCGTTTTGCCTACAATAATCTTCTTCTTCATCAAGAAATGGAAGAAATCCAAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024884
ATGCTAGTTCTATGCAACTTATCTACTGCTGCTCTCGTTTTGCCTACAATAATCTTCTTCTTCATCAAGAAATGGAAGAAATCCAAAAATAGAAATGTGATCAAATTGCCACCAGGCCCCATAACACTTCCTATAATCGGAAACCTGCATCAAATAAGCTCCCCTCCCTTCCGCTGCTTCACTGACTTAGCCGCCCGCCACGGCCCCATCATGTACCTCAGGCTGGGCGAGGCCCCCGCCGTGGTGGTGTCGTCACCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810420.1
MLVLCNLSTAALVLPTIIFFFIKKWKKSKNRNVIKLPPGPITLPIIGNLHQISSPPFRCFTDLAARHGPIMYLRLGEAPAVVVSSPEIAMLKDLDPSFANRPKGVALEIMWYGYLDIAFSPYGDYWRQMRKICINELLSPRMVRSFRSIRRDEAARLVDFLRESSGSSVNLTEKIFSFSSSITCRAAFGGVCNDREGLIKVMMETLRMAGGFEIADFFPSSRIVTALSWTKMRLKRMRRKLDVILDDVIDEHKENLAENA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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