当前解析结果
SmilChr05G003837| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003837 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003837 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003837 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 51827534 - 51829066 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131026099 |
|---|---|
| GeneID | 131026099 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026099 |
| 原始查询 | SmilChr05G003837 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026099 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057811855.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057811855.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.40000 | XP_057811855.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.40000 | XP_057811855.1 |
| 5 | P-body | P-body | 0.40000 | XP_057811855.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:51827536 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A9 |
Chr5:51827540 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B32,B79,C86,D4 |
Chr5:51827561 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C20,C36,C65 |
Chr5:51827577 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A8,B91 |
Chr5:51827599 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,B48,B96 |
Chr5:51827628 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B121,B53,B69,B70,C38 |
Chr5:51827651 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B108,B23,B25,C19,C4,C5,D4 |
Chr5:51827657 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B57 |
Chr5:51827660 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr5:51827668 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B10 |
Chr5:51827700 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B57,B72,C34 |
Chr5:51827704 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。