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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003838`

染色体: Chr05 坐标: 51836348-51840193 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003838`
名称	SmilChr05G003838
描述	uncharacterized SmilChr05G003838
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	51836348 - 51840193 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025005`
GeneID	`131025005`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025005`
原始查询	`SmilChr05G003838`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial ribosomal protein L27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834005]; symbol=AT5G40080; hit=AT5G40080; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Mitochondrial ribosomal protein L27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834005]; symbol=AT5G40080; hit=AT5G40080; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G40080` (AT5G40080) Mitochondrial ribosomal protein L27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834005] identity=77.1; qcov=0.954; evalue=9.08e-46; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005762 (mitochondrial large ribosomal subunit); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF09809 (MRP-L27)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025005

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057810586.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057810586.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810586.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810586.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810586.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:51837365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B71,C18,C43
`Chr5:51837375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B71,C18,C43
`Chr5:51837414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B120,B49,B71,C87
`Chr5:51838698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr5:51838705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810586.1

87 aa

MRP-L27

PF09809 MRP-L27 23-78 aa

XP_057810587.1

87 aa

MRP-L27

PF09809 MRP-L27 23-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810586.1`	Pfam	`PF09809`	MRP-L27	Family	23	78	1.1e-18	67.8	Mitochondrial ribosomal protein L27
`XP_057810587.1`	Pfam	`PF09809`	MRP-L27	Family	23	78	1.1e-18	67.8	Mitochondrial ribosomal protein L27

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954603.1
TCCATTTTCCCCAGTTTTAGAAATCAGAATCGGCTCCGCCTCCTTCCCCTTCAGCCTTCCCCAGTTCCCCCCGAATTTCTGCTACTCTGCGAGGGTTGAGGAAAGCGCCAAGCGACGTCGCTACCCTCCCCCAGTTCCCACCGGCGCATCTTACCTGCGTCACTGCCTTCCCCCAGTTCGTCGGCTAATCCACCGGCGATTCCCTTAGGCCTTTGCTTTCGAAAGTAAAAGAAATTCAATCAGGACTAGTTCCAGAAATT...

XM_057954604.1
ACGATAGTACAGATTATACCAATGATACCTGAGATGATCCAGTTTTGCAAATCTTGTGTCGTCGGATCAATTTTGTTTTGCTAATCTGCCTCAATAACCGATTAATTCGGATCGGGCCGGTTAATCGGTTAACCGAATCGTAAATCGGTTCGATTTTCAGTTATCACTTTGACTGTTAATCGGTTCCGGCTAACCGGTTCAGTTATAACCGAACCGGACCGATTACCAGTCCTACATATATTTAGCCATTTCTCCGCTTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131025005
ATGGCGTTAGGGCTGATATTGGGGATTGGGAGGACGTTCAGGAAGAAGCGAGCGTCGTCGCTCGATATTCTGACGTCGAAGAGGAGTCCTAAAGGCTATTACAAGGGCAAAAATTGCAAGCCCACCGGTTTCCACACTCGAAAAGGTGGTTATGTTGTGGTTCCTGAAAAGTTGCCAAACTACGTGGTGCCAGATTTGACGGGATTCAAGCTAAAGCCGTACGTATCACAGTGTGGAATACAGGCTTCTGAGTCATCTAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810586.1
MALGLILGIGRTFRKKRASSLDILTSKRSPKGYYKGKNCKPTGFHTRKGGYVVVPEKLPNYVVPDLTGFKLKPYVSQCGIQASESSK

XP_057810587.1
MALGLILGIGRTFRKKRASSLDILTSKRSPKGYYKGKNCKPTGFHTRKGGYVVVPEKLPNYVVPDLTGFKLKPYVSQCGIQASESSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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