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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003847`

染色体: Chr05 坐标: 51907305-51914978 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003847`
名称	SmilChr05G003847
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP95-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	51907305 - 51914978 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024904`
GeneID	`131024904`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024904`
原始查询	`SmilChr05G003847`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP95-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP95-like
Arabidopsis	`AT4G32420` (AT4G32420) Cyclophilin-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829377] identity=64.1; qcov=0.098; evalue=4.37e-22; confidence=weak
Rice	`Os02g0204300` (OsCYP95) - identity=43.7; qcov=0.412; evalue=3.47e-19; confidence=low
GO	GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00160 (Pro_isomerase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024904

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810436.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057810436.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057810436.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057810436.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810436.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:51907554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C46
`Chr5:51907599`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B129
`Chr5:51907599`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B129
`Chr5:51907604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B60
`Chr5:51907699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr5:51909700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C71
`Chr5:51909799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B50,C71
`Chr5:51909819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B139,B49,C10,C71
`Chr5:51910217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr5:51910863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:51910938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810436.1

764 aa

382

764

Pro_isomerase

PF00160 Pro_isomerase 10-171 aa

XP_057810437.1

755 aa

378

755

Pro_isomerase

PF00160 Pro_isomerase 10-171 aa

XP_057810439.1

655 aa

328

655

Pro_isomerase

PF00160 Pro_isomerase 5-62 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810436.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	10	171	4.3e-38	131.8	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD
`XP_057810437.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	10	171	4.2e-38	131.8	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD
`XP_057810439.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	5	62	2.2e-10	41.7	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954454.1
ATAGCTGAAGTTTGCTCTATGACACTAAAATAAAAATTAAAGAATAAAGTAGAGAGTAAAGGGTCTAGGTTTTTCTTTCCACAGCCACAGAGGCACGCACACACCCAACGCAAACACACAGTCACACACTCTCTCTTTCACACACCCACACCCAGACACATTTTCTGTGGAGAGGAGCTGCTCTGTCAGCTGCACCGCTTGGCAAGGGCTCAAAACCCTAGCACAAATTCTACTGGATGCTCCTCGTTCTTCGTTCGACA...

XM_057954453.1
ATAGCTGAAGTTTGCTCTATGACACTAAAATAAAAATTAAAGAATAAAGTAGAGAGTAAAGGGTCTAGGTTTTTCTTTCCACAGCCACAGAGGCACGCACACACCCAACGCAAACACACAGTCACACACTCTCTCTTTCACACACCCACACCCAGACACATTTTCTGTGGAGAGGAGCTGCTCTGTCAGCTGCACCGCTTGGCAAGGGCTCAAAACCCTAGCACAAATTCTACTGGATGCTCCTCGTTCTTCGTTCGACA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131024904
ATGAGTAAGACGAAAGTGCTAGTATTCTTGGATGTCTCAATCGATGGAGATCCTTATGAGAGGATGGTTTTCGAGCTATTCACTGATGTTGCTCCCAAGACTTGTGAAAATTTCCGCGCACTTTGCACTGGAGAAAAAGGTGTTAGTGTTAAAACCGGAAAACCACTACACTATAAAGGAACATTTTTCCATCGTATTATTGAAGGATATGTGGCTCAGGGAGGGGACTTTCTTAGGAAAGATGGTAAATGTGGGGAAAG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057810436.1
MSKTKVLVFLDVSIDGDPYERMVFELFTDVAPKTCENFRALCTGEKGVSVKTGKPLHYKGTFFHRIIEGYVAQGGDFLRKDGKCGESIYDGKFPDESPKLRHDGPGLLSMAIADRDERGSLFSITFKADHHLDRKNIVFGKLVKGHEVLKKMENVGDDEGKPTVTVKIVNSGELCDDKKKGNKLKMGKDAIDEYKNEVKRKGKHKKSSKKRRKRRRYYSSESDSSSESDTDSSESDSESDSDASSLSDSSSSSDDKHKKR...

XP_057810437.1
MSKTKVLVFLDVSIDGDPYERMVFELFTDVAPKTCENFRALCTGEKGVSVKTGKPLHYKGTFFHRIIEGYVAQGGDFLRKDGKCGESIYDGKFPDESPKLRHDGPGLLSMAIADRDERGSLFSITFKADHHLDRKNIVFGKLVKGHEVLKKMENVGDDEGKPTVTVKIVNSGELCDDKKKGNKLKMGKDAIDEYKNEVKRKGKHKKSSKKRRKRRRYYSSESDSSSESDTDSSESDSESDSDASSLSDSSSSSDDKHKKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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