当前解析结果
SmilChr05G003868| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003868 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003868 |
| 描述 | polyadenylate-binding protein-interacting protein 6-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 52272332 - 52274717 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131024971 |
|---|---|
| GeneID | 131024971 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024971 |
| 原始查询 | SmilChr05G003868 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | polyadenylate-binding protein-interacting protein 6-like |
| 产物 | polyadenylate-binding protein-interacting protein 6-like |
| Arabidopsis | AT5G25540 (CID6)CTC-interacting domain 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832629] identity=39.5; qcov=0.864; evalue=1.61e-26; confidence=medium |
| Rice | Os02g0780550- identity=47.1; qcov=0.342; evalue=6.09e-09; confidence=low |
| GO | GO:0043130 (ubiquitin binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024971 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057810546.1 |
| 2 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.20000 | XP_057810546.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057810546.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810546.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810546.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:52272587 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,B112,C19,C41,C85 |
Chr5:52273198 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr5:52273330 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B125,C41 |
Chr5:52273529 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。