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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003880`

染色体: Chr05 坐标: 52446309-52448982 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003880`
名称	SmilChr05G003880
描述	GTP-binding nuclear protein Ran1A-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	52446309 - 52448982 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024966`
GeneID	`131024966`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024966`
原始查询	`SmilChr05G003880`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GTP-binding nuclear protein Ran1A-like
产物	GTP-binding nuclear protein Ran1A-like
Arabidopsis	`AT5G55190` (RAN3) RAN GTPase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835612] identity=96.8; qcov=1; evalue=3.78e-164; confidence=high
Rice	`Os01g0611100` (OsRAN1) - identity=96.5; qcov=0.905; evalue=1.93e-148; confidence=high
GO	GO:0000054 (ribosomal subunit export from nucleus); GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006606 (protein import into nucleus)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03250 (Viral life cycle - HIV-1 - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024966

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810541.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057810541.1`
3	Midbody	Midbody	0.40000	`XP_057810541.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057810541.1`
5	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057810541.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:52446651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C5
`Chr5:52446788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,B78
`Chr5:52447648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,D2,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810541.1

221 aa

110

221

Arf

Roc

Ras

PF00025 Arf 13-138 aa PF08477 Roc 15-128 aa PF00071 Ras 15-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810541.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	13	138	8.5e-11	42.3	ADP-ribosylation factor family
`XP_057810541.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	15	128	2e-30	106.2	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057810541.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	15	171	1.2e-47	162.2	Ras family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954558.1
TTCTTTTCTTTTTATTGTTTGTTTTCGAGTATAAGTTCTCCAATTGGTGGGACTATGTGTGAGTGTGATAATGAGTGACAATTTTGTCTGCTTCGTTAAACCTAGTTTAGGTTCGGTCGGATAATTTGAGAAATTATATTTTTAGAGTTTCGAAAATGTTGAGATGTACTCCGAATCTCTGAAAATTCAATAAAGTTATATGGATTTGTGCAATTTTTCATGCTATCTCTGAGACGATATATGAGATAAGGCAATATCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024966
ATGGCGTTGCCGAATCAACAGACTGTGGATTACCCTAGCTTCAAGCTTGTTATTGTTGGAGATGGTGGCACTGGAAAGACTACCTTTGTGAAGAGGCATCTCACTGGAGAATTCGAGAAGAAATATGAACCAACTATCGGTGTGGAGGTTCATCCCTTGGATTTCTTCACTAACTGCGGGAAAATCCGATTTTATTGCTGGGACACTGCTGGTCAAGAGAAATTTGGTGGGCTTAGGGATGGATACTACATCCATGGACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810541.1
MALPNQQTVDYPSFKLVIVGDGGTGKTTFVKRHLTGEFEKKYEPTIGVEVHPLDFFTNCGKIRFYCWDTAGQEKFGGLRDGYYIHGQCAIIMFDVTARLTYKNVPTWHRDLCRVCENIPIVLCGNKVDVKNRQVKAKQVTFHRKKNLQYYEISAKSNYNFEKPFLYLARKLAGDPSLHFVESPALAPPEVQIDLAAQQQHEAELLQAASQPLPDDDDEAFD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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