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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003893`

染色体: Chr05 坐标: 52652460-52659142 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003893`
名称	SmilChr05G003893
描述	T-complex protein 1 subunit eta
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	52652460 - 52659142 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024918`
GeneID	`131024918`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024918`
原始查询	`SmilChr05G003893`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	T-complex protein 1 subunit eta
产物	T-complex protein 1 subunit eta
Arabidopsis	`AT3G11830` (AT3G11830) TCP-1/cpn60 chaperonin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820356] identity=93.3; qcov=0.961; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0687700` - identity=93.2; qcov=0.499; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005832 (chaperonin-containing T-complex); GO:0006457 (protein folding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	-
Pfam	PF00118 (Cpn60_TCP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024918

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810461.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057810461.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810461.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810461.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810461.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:52652821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B6,B66,C33
`Chr5:52653242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C20
`Chr5:52654452`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B51
`Chr5:52654452`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B51
`Chr5:52655557`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B11,C12,C23,C27,C80,C83
`Chr5:52655564`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C38
`Chr5:52655564`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C38
`Chr5:52657037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C72
`Chr5:52657056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr5:52657189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr5:52657194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr5:52657249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810461.1

559 aa

280

559

Cpn60_TCP1

PF00118 Cpn60_TCP1 35-528 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810461.1`	Pfam	`PF00118`	Cpn60_TCP1	Family	35	528	4.1e-162	541.0	TCP-1/cpn60 chaperonin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954478.1
AAAAACCACTAGAAACCCTCCAAAGGCCTCGCCATTAAACCCTAGAACATTCATTCTCTCGCTTCAACTCCTCGCGCTACAAGGTCACCATCTTCACGGAGAAACTCAAATCTTAGCAATGTCATCTATGCTGCAACCCCAAATTATACTGCTCAAGGAAGGAACTGATACATCTCAAGGAAAACCACAATTAATAAGCAACATAAATGCGTGCTCGGCTGTGGCTGATGTCGTGCGAACTACTCTTGGTCCAAGGGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024918
ATGTCATCTATGCTGCAACCCCAAATTATACTGCTCAAGGAAGGAACTGATACATCTCAAGGAAAACCACAATTAATAAGCAACATAAATGCGTGCTCGGCTGTGGCTGATGTCGTGCGAACTACTCTTGGTCCAAGGGGCATGGACAAATTGATCCATGATGACAAGGGGAATACCACCATCTCTAATGATGGTGCCACCATAATGAAGCTTCTTGACATTGTTCATCCTGCTGCCAAGATCCTTGTTGACATTGCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810461.1
MSSMLQPQIILLKEGTDTSQGKPQLISNINACSAVADVVRTTLGPRGMDKLIHDDKGNTTISNDGATIMKLLDIVHPAAKILVDIAKSQDSEVGDGTTTVVLLAGEFLKEAKPFIEDGVHPQNLIRSYRTASSLAIEKIKELAVSIEGKSLEEKKSLLAKCAATTLSSKLIGGEKEFFATMVVDAVLAIGLEDRLNMIGMKKVPGGTMRDSFLVNGVAFKKTFSYAGFEQQPKKFLNPKILLLNIELELKSEKENAEIRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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