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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003894`

染色体: Chr05 坐标: 52677033-52683152 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003894`
名称	SmilChr05G003894
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	52677033 - 52683152 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026105`
GeneID	`131026105`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026105`
原始查询	`SmilChr05G003894`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=28.2; qcov=1.11; evalue=3.1e-34; confidence=low
Rice	`Os03g0164400` - identity=25.7; qcov=1.02; evalue=2.98e-35; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026105

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811860.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811860.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811860.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811860.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811860.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:52677073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:52677086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B117,B133
`Chr5:52677348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B46
`Chr5:52677359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B90,C18
`Chr5:52677411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,C65
`Chr5:52677422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B123,C15
`Chr5:52677422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C15
`Chr5:52677439`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	37	A1,A18,A23,A24,A4,B100,B105,B109,B119,B133,B17,B30,B34,B4,B40,B45,B47,B52,B55,B58,B6,B64,B66,B73,B80,B93,C29,C31,C33,C36,C46,C52,C6,C78,C8,D1,D3
`Chr5:52677451`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	181	A1,A11,A14,A16,A18,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A7,A8,B1,B10,B100,B102,B104,B105,B106,B109,B110,B112,B113,B115,B119,B12,B121,B123,B124,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B35,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B47,B5,B50,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B84,B85,B86,B87,B88,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B98,B99,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C19,C22,C24,C25,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C36,C37,C4,C43,C46,C48,C49,C5,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D6,D7,D8,D9
`Chr5:52681978`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B107,C2,C58,C62
`Chr5:52681978`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B107,C2,C58,C62
`Chr5:52681979`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B107,C2,C58,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811860.1

364 aa

182

364

MULE

PF10551 MULE 196-253 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811860.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	196	253	7.6e-16	59.0	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955877.1
ATGGAAGAAAATGTCAATAACGATGAGTTTTATATTCCTCAAGTTACAGAAGAGAGAATACCAAAAGCGGGAATGAAATTTTTATCAGTAGAGGCGGCATTTTCATTCTACAACCAATATGCACGAGAAGCGGGCTTTAGTGCTAGAATAAGCAATAGCAAGAAGAATAAGGTGACAAATGAAATCTTTTGGAAACAAATTGTTTGCTTCAATAAGAAGGTCATACAGATCAGTCGTGTTCTAATAAACGGGAGTCCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026105
ATGGAAGAAAATGTCAATAACGATGAGTTTTATATTCCTCAAGTTACAGAAGAGAGAATACCAAAAGCGGGAATGAAATTTTTATCAGTAGAGGCGGCATTTTCATTCTACAACCAATATGCACGAGAAGCGGGCTTTAGTGCTAGAATAAGCAATAGCAAGAAGAATAAGGTGACAAATGAAATCTTTTGGAAACAAATTGTTTGCTTCAATAAGAAGGTCATACAGATCAGTCGTGTTCTAATAAACGGGAGTCCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811860.1
MEENVNNDEFYIPQVTEERIPKAGMKFLSVEAAFSFYNQYAREAGFSARISNSKKNKVTNEIFWKQIVCFNKKVIQISRVLINGSPSKVHLLRSHRSVSIAKRALTQQFSKANVPTCQQMRLLEIEYGGPGHVGCTERDIRNIEQELRDEQKGVDAETLIEFFASEKDKNPTFFFDYETDSNKMFRRCFWADPKSMSDEKTESFIWLLKKWMEAMPTGAPKVIITDQDPAMTKAIAQVLPFTVHRYCLWHILTKFPDKVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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