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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003895`

染色体: Chr05 坐标: 52685588-52689172 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003895`
名称	SmilChr05G003895
描述	photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	52685588 - 52689172 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024981`
GeneID	`131024981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024981`
原始查询	`SmilChr05G003895`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 3, chloroplastic-like
产物	photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G32590` (AT4G32590) 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829394] identity=80.2; qcov=0.69; evalue=6.1e-53; confidence=high
Rice	`Os05g0555300` - identity=79.8; qcov=0.708; evalue=8.64e-54; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding); GO:0140647 (P450-containing electron transport chain)
KEGG	-
Pfam	PF00111 (Fer2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810556.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057810556.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057810556.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810556.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810556.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:52686482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B35,C23
`Chr5:52686572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr5:52688307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810556.1

168 aa

168

Fer2

PF00111 Fer2 102-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810556.1`	Pfam	`PF00111`	Fer2	Domain	102	150	6.7e-08	33.1	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102038.1
CTTTGTTTGAAGTAAAATGGCTATTATTATTATAACCACCGGCAATATTGGAGCCACGGATTAGAAAATAGAAAGAGGGTGCGGCGAAGGATAGTGTTTGCATGCTATTTTCTGAGGCAATATGGCAGCCATGAGTTTCTGCCACGTGTCACTCCGCCCACCGGAAATCTCCGCCGCCACCTCCAACAACCGCACGTCCGCCGCGTTTCCTTCTACAAGGAGGAACTTTTCTGTTTTTGCCGCTGCTTCGCCGGAAACTT...

XM_057954573.1
CCCTTCTTTCTTGCTATCCAACAAAAACTACACCAATTCGTAGATGGAGCTAACTTGGATCGATTAACAATCAATCCTTGCTCTTTATCTCCGTCTTTGCTCGATCCTAGTCCGATGGAGATCAGGTGCATGGATCACGTTTCTCATTTGAGAGCATGTAAATCGATGATTATGGCTTCGAATCGAACAACTAGAGGCAACAGCGCAACTAAATAAAAAGTTAGAACAAGTAACAAACAATAAAAAGAACCCTTCCGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024981
ATGGCAGCCATGAGTTTCTGCCACGTGTCACTCCGCCCACCGGAAATCTCCGCCGCCACCTCCAACAACCGCACGTCCGCCGCGTTTCCTTCTACAAGGAGGAACTTTTCTGTTTTTGCCGCTGCTTCGCCGGAAACTTCCACCGCGCCTCTGGAACCGGAACAACCCGAGATCGAGCTAGAATTCCTCGGGCCTAAATCAGGAGATGCAGTGAACAGAGCCGAAGCCATAAGTGGAGAGAAGCTGCTGAGGAATATAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810556.1
MAAMSFCHVSLRPPEISAATSNNRTSAAFPSTRRNFSVFAAASPETSTAPLEPEQPEIELEFLGPKSGDAVNRAEAISGEKLLRNIMLDNKIELYATYGKLMNCGGGGSCGTCIVEIIDGKDLLNERTNTELRYLKKKPESWRLACQTIVGNKENSGKVVVQRLPQRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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