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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003913`

染色体: Chr05 坐标: 52855738-52856519 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003913`
名称	SmilChr05G003913
描述	brassinosteroid-responsive RING protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	52855738 - 52856519 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024983`
GeneID	`131024983`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024983`
原始查询	`SmilChr05G003913`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	brassinosteroid-responsive RING protein 1-like
产物	brassinosteroid-responsive RING protein 1-like
Arabidopsis	`AT3G61460` (BRH1) brassinosteroid-responsive RING-H2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825319] identity=60.6; qcov=0.994; evalue=2.09e-68; confidence=high
Rice	`Os04g0579200` - identity=51.3; qcov=0.705; evalue=7.84e-35; confidence=medium
GO	GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13445 (zf-RING_UBOX); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF14634 (zf-RING_5); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024983

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057810559.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057810559.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057810559.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057810559.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057810559.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:52855845`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A20,A21,A3,B120,B13,B135,B136,B40,B90,B93,B99,C1,C26,C28,C3,C35,C47,C49,C54,C56,C59,C61,C67,C76,C77,C83,C9
`Chr5:52855847`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	A20,A21,A3,B120,B13,B135,B136,B140,B40,B90,B93,B99,C1,C26,C28,C3,C35,C47,C49,C54,C56,C59,C61,C67,C76,C77,C83,C9
`Chr5:52855854`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A20,A21,A3,B120,B13,B135,B136,B140,B40,B85,B90,B93,B99,C1,C26,C28,C3,C35,C47,C49,C54,C56,C59,C61,C67,C76,C77,C83,C9
`Chr5:52855942`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B114,B134,B48,B77,C10,C24,C3,C30
`Chr5:52855960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B92,D10
`Chr5:52856090`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A14,A8,B100,B105,B21,B78,C22,C34,C50,D4
`Chr5:52856098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr5:52856101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:52856111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B133
`Chr5:52856160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B100,B51,C50
`Chr5:52856163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr5:52856165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B100,B51,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810559.1

166 aa

166

zf-RING_11

zf-RING_2

zf-RING_5

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

zf-C3HC4_2

PF17123 zf-RING_11 86-115 aa PF13639 zf-RING_2 86-130 aa PF14634 zf-RING_5 86-131 aa PF13445 zf-RING_UBOX 87-127 aa PF00097 zf-C3HC4 87-129 aa PF13923 zf-C3HC4_2 87-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810559.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	86	115	5.4e-08	33.1	RING-like zinc finger
`XP_057810559.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	86	130	2.2e-13	51.0	Ring finger domain
`XP_057810559.1`	Pfam	`PF14634`	zf-RING_5	Domain	86	131	1.2e-06	29.0	zinc-RING finger domain
`XP_057810559.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	87	127	6.6e-07	29.9	RING-type zinc-finger
`XP_057810559.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	87	129	8.1e-08	32.7	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057810559.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	87	129	6e-07	29.9	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954576.1
ATGATGAGGTGGAGGGAAGCGGTGTAAAAGTAATTGGCAGTGTGAGGTAATTTAAACGGAATCCGCACAGGTGTCGCCCAACCACACGCACAGAAACGTGATTGCTCTTTCACTCTCATCTTCTCTCCTATATAAATATAAATACAAAGCCTCCCTCCCTCCTCCATAACCAAAATGGGCTTCCCACTCGGCTACACCGACCTATTTCTCCCCAAATTGCTCCTCTCCCTCCTCGCAATCCTCGGCTTCTTCCGCCGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024983
ATGGGCTTCCCACTCGGCTACACCGACCTATTTCTCCCCAAATTGCTCCTCTCCCTCCTCGCAATCCTCGGCTTCTTCCGCCGATTCACGCACGCTCTTCTCTCGATCCTAGGGCTCGCCGATTTCCTCGATCCAGGAACCGCCTCCTACCCGCTCCGCCACCATTCCGCCTCCGAGCCGCGCTCCGTCTCCGCGGCGCTCATCCGCGAGCTTCTTCCGGTGGTCAAGTTCTCCGATTTGGCGGCGGGGCCCGAAAACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810559.1
MGFPLGYTDLFLPKLLLSLLAILGFFRRFTHALLSILGLADFLDPGTASYPLRHHSASEPRSVSAALIRELLPVVKFSDLAAGPENCAVCLYEFHGEDEIRRLANCRHIFHRSCLDRWMDHDQKTCPLCRTQFVPEEMQAAFNEKLWLASGISDLYGEYLPISSGL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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