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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003916`

染色体: Chr05 坐标: 52878754-52880551 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003916`
名称	SmilChr05G003916
描述	phosphoglycerate mutase-like protein AT74H
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	52878754 - 52880551 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024950`
GeneID	`131024950`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024950`
原始查询	`SmilChr05G003916`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoglycerate mutase-like protein AT74H
产物	phosphoglycerate mutase-like protein AT74H
Arabidopsis	`AT3G05170` (AT3G05170) Phosphoglycerate mutase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819681] identity=51.9; qcov=0.799; evalue=8.31e-97; confidence=high
Rice	`Os06g0109000` - identity=66.9; qcov=0.844; evalue=1e-130; confidence=high
GO	GO:0016791 (phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00300 (His_Phos_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024950

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057810511.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810511.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057810511.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810511.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810511.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:52879020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B59,B89
`Chr5:52879406`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B26
`Chr5:52879406`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B26
`Chr5:52879543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B43
`Chr5:52879544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B94
`Chr5:52880042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B48,B98,C33
`Chr5:52880053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,C11,C46,C69
`Chr5:52880055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr5:52880155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B42,B43
`Chr5:52880230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C24,C3,D11
`Chr5:52880254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B20,C58
`Chr5:52880273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810511.1

333 aa

166

333

His_Phos_1

PF00300 His_Phos_1 45-253 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810511.1`	Pfam	`PF00300`	His_Phos_1	Domain	45	253	2e-28	100.2	Histidine phosphatase superfamily (branch 1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954528.1
ATCAATACAAAATATTCATCAATCACAAGACTTTGCTACTTTCAATTATGAAACATGTATGCCGTCTAAATTAGTCTATATACTTAAATGTTACAAAGGGGATTGATTTTAAAAGAAGAAGAAGATGACTTGGAATATTTTTTTTGCAAATATTCTGAAGATTTGCATATGCCTCTCAAATATTGCAACCTATCTATCCTAGTCCCAAACTAGTTGAAAACAAAAGGAGAGAGAAAAGCTCCATATCTTGGAGTGATATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024950
ATGGCTGGGCTAAACTCTAGATTTCCCTGCAACACTTGTGCCATAATATGCAGCCATGAAAGCAACAATGGTTTCCCTGAAAAATCCAGAGCTTCAAGTTCAATGAGGGCTAAGCCGCCCCGGCCACGAAGGATAATCCTAGTCCGACACGGGCAGAGTCAAGGAAACGTGGACGAGTGTGTGTACACGCGCGTGGCAGACCCGAAGGTGATGCTGACGGAGCAGGGGGCGGCCGAGGCGGAGGAGTGTGGGAGAGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810511.1
MAGLNSRFPCNTCAIICSHESNNGFPEKSRASSSMRAKPPRPRRIILVRHGQSQGNVDECVYTRVADPKVMLTEQGAAEAEECGREIRRMIERDGVHDWKVYFYVSPYRRSLETLRNLAKAFEKSRIAGVREEPRLREQDFGNFQDQEQMKIQKAARKQYGRFFYRFPNGESAADVYDRITGFRETLRSDIDIGRFQPPGEQSPNMNLVIVSHGLTLRVFLMRWYKWTVEQFEGLHNFGNGKVLVMERGYGGRYSLLMHH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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