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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003919`

染色体: Chr05 坐标: 52949171-52957577 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003919`
名称	SmilChr05G003919
描述	golgin candidate 6-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	52949171 - 52957577 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024900`
GeneID	`131024900`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024900`
原始查询	`SmilChr05G003919`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	golgin candidate 6-like
产物	golgin candidate 6-like
Arabidopsis	`AT3G27530` (GC6) golgin Putative 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822375] identity=67.6; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0538900` - identity=62.2; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005795 (Golgi stack); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0012507 (ER to Golgi transport vesicle membrane); GO:0045056 (transcytosis); GO:0048211 (GO:0048211); GO:0048280 (vesicle fusion with Golgi apparatus)
KEGG	-
Pfam	PF04869 (Uso1_p115_head); PF04871 (Uso1_p115_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024900

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057810431.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057810431.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810431.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810431.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057810431.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:52949828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B70,B82,C78
`Chr5:52950945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr5:52951461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:52951681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B74,B90,B92,C55
`Chr5:52952170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:52952181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B74,B90,B92,C55
`Chr5:52952412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C13,D5
`Chr5:52952424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B62,C1,C43
`Chr5:52952532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:52952563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr5:52952797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr5:52954248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810431.1

916 aa

458

916

Uso1_p115_head

Uso1_p115_C

PF04869 Uso1_p115_head 373-687 aa PF04871 Uso1_p115_C 789-912 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810431.1`	Pfam	`PF04869`	Uso1_p115_head	Repeat	373	687	2.7e-26	93.1	Uso1 / p115 like vesicle tethering protein, head region
`XP_057810431.1`	Pfam	`PF04871`	Uso1_p115_C	Family	789	912	5.2e-27	95.2	Uso1 / p115 like vesicle tethering protein, C terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954448.1
GATGTCCGGGTTTATGACATCAAACTATTCATTCAAGTGAAGACTTTGTGTCGACCTGTCAGCCCGATCCAAATTAATTTTCTTGACCCGACCCGACCCTTTTAGATATCATCATCTCTCTCCGACTCCGACGTTCTCTTTTGTTCTGCAACTTCTTGCTTTGGGGCTTTTCTCTGGTCTTCGCTTCTTTGCTCGTCTTCTTAAATTCTTGTTCACTGCTTGGAACTCGGGAAGCTTCGATTTTTCGGGGAGGGCAGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024900
ATGGATTTGGTATCGAAGTATCAGGGTGTGGTGGGGCGCGTTTTTGGAAATGACAATTCGAGTTCGAATGATGACAGCTATGTAGAGCGCTTGCTTGATCGCATTAGCAATGGCCAACTAGCTGATGACAGGAGGTCAGCCATGGCTGAACTTCAGTCTGTTGTGGCAGAAAGTCATGCTGCGCAGTTAGCTTTTGGAGCAATGGGCTTTCCGGTACTGTTGAGTGTCTTAAAGGAGGAGCGTGATGATGTAGAAATGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810431.1
MDLVSKYQGVVGRVFGNDNSSSNDDSYVERLLDRISNGQLADDRRSAMAELQSVVAESHAAQLAFGAMGFPVLLSVLKEERDDVEMIRGAIETLVSAVSPTQHPKLSKNEVQPALMNSDLLSREVENISLLLSLLSEEDFYIRYYTLQLLTALLTNSPTRLQEAILTIPRGITRLVDMLMDREVIRNEALLLLTYLTREAEEIQKILVFEGAFEKIFSIIIEEGGSEGGVVVQDCLELLNNLLRNNTSNQVLLRETIGFD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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