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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003929`

染色体: Chr05 坐标: 53057485-53059626 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003929`
名称	SmilChr05G003929
描述	uncharacterized SmilChr05G003929
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53057485 - 53059626 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024952`
GeneID	`131024952`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024952`
原始查询	`SmilChr05G003929`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834148]; symbol=AT5G41470; hit=AT5G41470; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834148]; symbol=AT5G41470; hit=AT5G41470; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41470` (AT5G41470) Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834148] identity=40.2; qcov=0.845; evalue=8.44e-59; confidence=medium
Rice	`Os09g0266000` (B1012G11.37-1) - identity=36.8; qcov=0.537; evalue=3.36e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12680 (SnoaL_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024952

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810513.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057810513.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810513.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810513.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810513.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53057959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr5:53058027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B131
`Chr5:53058245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B45,B59,B89
`Chr5:53058261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	77	A15,A22,A25,A7,B101,B102,B103,B106,B107,B109,B114,B118,B121,B123,B125,B127,B128,B129,B132,B137,B19,B20,B23,B25,B27,B3,B32,B34,B47,B49,B54,B55,B6,B61,B67,B71,B73,B74,B79,B89,B90,B92,B97,B98,C1,C10,C13,C17,C18,C23,C26,C36,C42,C43,C44,C48,C49,C50,C51,C56,C57,C58,C59,C60,C61,C62,C63,C65,C7,C71,C74,C79,C80,C81,C83,C87,D1
`Chr5:53058293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:53058294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C77
`Chr5:53058303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr5:53058643`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C20
`Chr5:53058643`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C20
`Chr5:53059015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B136
`Chr5:53059023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:53059054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B130,B136,B66,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810513.1

308 aa

154

308

SnoaL_2

PF12680 SnoaL_2 85-179 aa

XP_057810514.1

283 aa

142

283

SnoaL_2

PF12680 SnoaL_2 85-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810513.1`	Pfam	`PF12680`	SnoaL_2	Domain	85	179	5.7e-06	27.6	SnoaL-like domain
`XP_057810514.1`	Pfam	`PF12680`	SnoaL_2	Domain	85	179	4.9e-06	27.8	SnoaL-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954530.1
AAAAATTAAAAGGGCATTTACTTGCCACATTTTAAAATTAAGTTGATGTTACATGATCAAAATTCATGATTTAAATGACAATTACCCTTACTTTTATTGATTCCTTGTTTGCAGTTGAAGGCATGGACATCTTAATCAGGATAACAAACCATTATACCTTTTCTGCCTCTAAAGCAACTAGACATGTTGTGAACTCCACACATAATATGTTTCAATGCATCAAAATGCACTACACTATTTCCAGGTAAATCAGATTGCAA...

XM_057954531.1
AAAAATTAAAAGGGCATTTACTTGCCACATTTTAAAATTAAGTTGATGTTACATGATCAAAATTCATGATTTAAATGACAATTACCCTTACTTTTATTGATTCCTTGTTTGCAGTTGAAGGCATGGACATCTTAATCAGGATAACAAACCATTATACCTTTTCTGCCTCTAAAGCAACTAGACATGTTGTGAACTCCACACATAATATGTTTCAATGCATCAAAATGCACTACACTATTTCCAGGTAAATCAGATTGCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024952
ATGGCAGCTGCTACCATAGAATTTAGCAGTTTCATTTCAAGGCAGTTTATACCAACAAAAGGAACATCAAAGCATTCCATTCCCACTATCCCAATGAGAAAATCGAACCTATTTCAACCACTAGAGATTAAGATGGCGCCTCAAACCCGCTCAAACAAGGCTACAAAGAGAAAATCATTTAAGCTATTTGTGGTTCCACCTAGAAGTCCTGCATTCGACACGAGTTCACCTTCTCCTGCTCAAACAGTCATGCAGTTCTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810513.1
MAAATIEFSSFISRQFIPTKGTSKHSIPTIPMRKSNLFQPLEIKMAPQTRSNKATKRKSFKLFVVPPRSPAFDTSSPSPAQTVMQFYSSINEKNLMQLDKLIAQDCCFEDYSFPKPFHGKKEVMHFLEQLSMCMGDYKNMRFNVELICEGNDSTVVVNWHLVWKKIQVPFTRGCSYFSLSENDDKLLIKKAQVLIESPIKLGFVALAIFKTVSSLFDAFPAATECMQAFPFPILNCYTHPTNTTSPAHAGFLKSPHTMFR...

XP_057810514.1
MAAATIEFSSFISRQFIPTKGTSKHSIPTIPMRKSNLFQPLEIKMAPQTRSNKATKRKSFKLFVVPPRSPAFDTSSPSPAQTVMQFYSSINEKNLMQLDKLIAQDCCFEDYSFPKPFHGKKEVMHFLEQLSMCMGDYKNMRFNVELICEGNDSTVVVNWHLVWKKIQVPFTRGCSYFSLSENDDKLLIKKAQVLIESPIKLGFVALAIFKTVSSLFDAFPAATEWFLKSPHTMFRLLLKAYNIGVQPVITPFLAWYIKLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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