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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003940`

染色体: Chr05 坐标: 53171662-53178336 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003940`
名称	SmilChr05G003940
描述	monodehydroascorbate reductase, chloroplastic/mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53171662 - 53178336 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024925`
GeneID	`131024925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024925`
原始查询	`SmilChr05G003940`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	monodehydroascorbate reductase, chloroplastic/mitochondrial
产物	monodehydroascorbate reductase%2C chloroplastic/mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G63940` (MDAR6) monodehydroascorbate reductase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842697] identity=77.5; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0151800` (OsMDAR5) - identity=76.7; qcov=0.9; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016651 (oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00070 (Pyr_redox); PF07992 (Pyr_redox_2); PF21791 (MDHAR3-like_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057810469.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057810469.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057810469.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810469.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810469.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53172101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,C58,C87
`Chr5:53173135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:53175211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:53175485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C4
`Chr5:53175698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C22
`Chr5:53176945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr5:53178037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr5:53178059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810469.1

500 aa

250

500

Pyr_redox_2

Pyr_redox

MDHAR3-like_C

PF07992 Pyr_redox_2 65-378 aa PF00070 Pyr_redox 221-303 aa PF21791 MDHAR3-like_C 397-478 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810469.1`	Pfam	`PF07992`	Pyr_redox_2	Domain	65	378	2.9e-57	195.0	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
`XP_057810469.1`	Pfam	`PF00070`	Pyr_redox	Domain	221	303	4.3e-18	66.3	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
`XP_057810469.1`	Pfam	`PF21791`	MDHAR3-like_C	Domain	397	478	1.4e-21	77.2	Monodehydroascorbate reductase 3-like, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954486.1
AGGAAAAATACAAACTATGATGTCGGCCCATTCCATTTCACCGGAAAAAGTCGCCACCGCTGTTCCAGACGTCCCTTTCACTCCGCCAATCACCGCCGCACACGCGCACAGTAAACCCATGGCTCTTGAATCTTCAGAAGAGCCAATTTCCTATTAAATTAAATGATCAATCCATTTATCCCCAATTATTATATTCTCAAGGATATATAAACCTAAATCATCTCTTCACCCCAATGTCTTCTTCTTCAGTTTGTAGAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024925
ATGTCTTCTTCTTCAGTTTGTAGAGCGAGAATGTCGAGTATTTCGCACGCGCTGTCGCTGAAGCACGGGCTTTCTCTCTGGTGCCCCCAATTAGCTTCAGTGAATAAGATTTCCGAGCCTTCTTGCATTGGCTCCGCAAGATTTAGCCGGAGATTAACTGTCTCAGCTTCGTCTTTCGCCAACGAGAATCGGGAATATGTTATAGTAGGTGGTGGAAATTCAGCTGGTTATGCTGCTCGGACTTTTGTTGAGCATGGAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810469.1
MSSSSVCRARMSSISHALSLKHGLSLWCPQLASVNKISEPSCIGSARFSRRLTVSASSFANENREYVIVGGGNSAGYAARTFVEHGVADGKLCIVSKEAYAPYERPALTKGYLFPLDKKPARLPGFHTCVGSGGERQTPEWYNEKGIEMLYEDPVTNIDIEKQTLITNSGKLVKYGALIIATGCTASRFPDKIGGNLAGVHYIRDVADANSLISSLEKAKKVVIVGGGYIGMEVAAAAVGWKLDTTIIFPEDHLMTRLFT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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