当前解析结果
SmilChr05G003943| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003943 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003943 |
| 描述 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP20-2, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 53198605 - 53200335 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024964 |
|---|---|
| GeneID | 131024964 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024964 |
| 原始查询 | SmilChr05G003943 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP20-2, chloroplastic |
| 产物 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP20-2%2C chloroplastic |
| Arabidopsis | AT3G60370 (AT3G60370)FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825208] identity=73.1; qcov=0.995; evalue=3.78e-100; confidence=high |
| Rice | Os07g0490400 (OsFKBP20-2)- identity=74.2; qcov=0.939; evalue=8.37e-103; confidence=high |
| GO | GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00254 (FKBP_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024964 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057810538.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057810538.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.20000 | XP_057810538.1 |
| 4 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057810539.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057810538.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057810538.1PF00254
FKBP_C 141-206 aa
XP_057810539.1PF00254
FKBP_C 92-157 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057810538.1 |
Pfam | PF00254 |
FKBP_C | Domain | 141 | 206 | 7.6e-18 | 65.3 | FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase |
XP_057810539.1 |
Pfam | PF00254 |
FKBP_C | Domain | 92 | 157 | 5.6e-18 | 65.8 | FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。